Dr. Enrique Merino Perez
Investigadora Titular C Tiempo Completo
Bioinformática aplicada a las ciencias ómicas
Biología de sistemas
Biología sintética
Metagenómica ambiental
Regulación génica en bacterias
Número de registros: 22
- Activos
- Vencidos
- Descubriendo nuevos paradigmas de la regulación genética basada en rnas pequeños y chaperonas de rna en organismos procariontes, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2023 - 2025
- Plasticidad genómica de aislados clínicos secuenciales del hongo patógeno de humanos candida glabrata: consecuencias para la resistencia a antifúngicos y la capacidad de adhesión, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2021 - 2023
- Regulación de la expresión genética basada en riboswitch t-box en firmicutes y otras bacterias gram-positivas, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2017 - 2020
- Caracterización funcional de riboswitches dispuestos de manera contigua en los genomas procariontes, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 1900
- Identificación in silico y caracterización molecular de la regulación genética basada en riboswit-ches que actúan in trans (trans-acting riboswitches) o que se transcriben en sentido opuesto al de su gen blanco (antisene-acting riboswitches), CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2020 - 2022
- Identificación in silico y caracterización molecular de la regulación genética basada en riboswitches que actúan en trans (trans-acting riboswitches) o que se transcriben es en sentido opuesto al de su gen blanco (antisene-acting riboswitches), DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2020 - 2022
- Generando nuevos paradigmas dentro de la biología sintética aplicados al estudio de estresomas celulares, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2016 - 2019
- Desarrollo de un nuevo enfoque computacional para la identificación de sitios de unión de factores transcripcionales bacterianos y su corroboración experimental en miembros de la familia lysr, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2015 - 2018
- Analisis de genomas y proteomas, PRESUPUESTO UNAM, 2014 - 2020
- Desarrollo de un nuevo enfoque computacional para la identificación de sitios de unión de factores transcripcionales bacterianos. la familia de regulación lysr como modelo de estudio, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2014 - 2017
- Regulación de la expresión genética basada en riboswitches, identificación in silico y su caracterización funcional, molecular y cinética, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2012 - 2015
- Análisis de la energía de desestabilización y curvatura estática del dna como elementos de la regulación transcripcional en genomas y metagenomas, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2011 - 2013
- Termoriboswitches: moleculas de rna regulatorias responsivas a temperatura, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2009
- Riboswitches como blancos de nuevos agentes antimicrobianos, FONDO SECTORIAL DE INVESTIGACIÓN EN SALUD Y SEGURIDAD SOCIAL, 2008 - 2011
- Análisis de la curvatura estática del dna, genomas y metagenomas, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2008 - 2010
- Identificación in silico y caracterización molecular, estructural y cinética de elementos de regulación de la expresión genética basada en riboswitches, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2007 - 2010
- Análisis de la curvatura estática del dna. 4a. etapa., DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2005 - 2007
- Predicción de redes de regulación mediante genómica comparativa, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2004 - 2006
- Análisis de la curvatura estática del dna cromosomal. estudio genoma, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2004 - 2005
- Análisis de la curvatura estática del dna cromosomal. estudio evolutivo y posible función en el genoma. tercera etapa., DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2003 - 2004
- Análisis de la curvatura estátita del dna cromosomal. estudio evolutivo y posible función en el genoma. segunda etapa., DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2000 - 2002
- Análisis de la curvatura estátita del dna cromosomal. estudio evolutivo y posible función en el genoma, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 1998 - 2000
Nivel Investigador Emérito del SNII
Doctorado, en Biotecnología, Colegio de Ciencias y Humanidades-CEINGEBI-IBt-UNAM, 1993
Maestría, en Investigacion Biomedica Basica, Colegio de Ciencias y Humanidades-CEINGEBI-UNAM (1988)
Licenciatura, Ingeniería Civil, Fac. de Ingeniería-UNAM (1982)
- Activos
- Graduados
-
Doctorado
-
Licenciatura
1 - Carrera Reyna, Maricela (2025). Identificación in silico y análisis comparativo del regulón s54 en organismos procariontes.
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Bioquímicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
2 - Serrano Gutierrez, Mariela (2024). Identificacion in silico y caracterizacion molecular de la regulacion genetica basada en riboswitches que se transcriben en sentido opuesto al de su gen blanco (antisense-acting riboswitches).
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
3 - Estrada Guerra, Karel Johan (2024). Análisis in silico de las secuencias de unión a ribosoma que definen el inicio de la traducción en procariontes.
Instituto de Investigacion en Ciencias Basicas y Aplicadas,
Doctorado en Ciencias,
UAEM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
4 - Sanchez Contreras, Juan Manuel (2024). Desarrollo de un protocolo computacional para el diseno automatizado de oligonucleotidos a ser utilizados en ensayos de identificacion altamente especifica y sensible de muestras clinicas de Candida glabrata y otros organismos patogenos.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
5 - Almanza Rodríguez, Guillermo (2024). Caracterización del loop de especificidad de Riboswitches de T-box en organismos Firmicutes mediante análisis bioinformáticos y su correlación con la frecuencia de ocupación de codones.
Licenciatura en Ingeniería Bioquímica,
Tecnológico Nacional de México en Celaya.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
6 - Barcelo Antemate, Diana (2023). Efecto del sesgo del contenido de GC genómico de organismos procariotas en las estructuras secundarias de sus proteínas.
Instituto de Investigacion en Ciencias Bascias y Aplicadas,
Doctorado en Ciencias,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
7 - Chavez Fuentes, Joselyn Cristina (2021). Analisis de los elementos de regulacion transcripcional a traves de los phyla bacterianos y de archaeas.
Instiotuto de Biotecnología,
Doctorado en Ciencias Bioquímicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
8 - Sánchez Olmos, Maria del Carmen (2020). Implementación de un nuevo método para la integración cromosómica múltiple y sucesiva de elementos genéticos :
un enfoque para la creación de circuitos epigenéticos en biología sintética .
Facultad de Ciencias,
Licenciatura en Biología,
UNAM.
*
Asesor: Merino Pérez, Enrique
9 - Carrera Reyna, Maricela (2020). Identificacion de promotores sigma 54 bacterianos con base en la conservacion de secuencia nucleotidica .
Instituto de Biotecnologia,
Maestría en Ciencias Bioquímicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
10 - Rodriguez Garcia, Edgar (2019). Identificacion de riboswitches que actuan in cis e in trans en genomas bacterianos .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
11 - Hernandez Santos, Walter Josue (2019). Analisis del papel de las chaperonas de RNA en la regulacion mediada por sRNAs en bacterias .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
12 - Rodriguez Mejia, Jose Luis (2017). Analisis del efecto de estructuras secundarias alrededor del sitio de union a ribosoma sobre la traduccion de proteinas GFP como caso de estudio .
Centro de Ciencias Genomicas,
Doctorado en Ciencias Biomedicas,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
13 - Rodriguez Escamilla, Zuemy (2017). Ingenieria de sistemas de regulacion genetica en organismos bacterianos mediante sRNA pequenos y la proteina chaperona de RNA Hfq .
Centro de Ciencias Genomicas,
Doctorado en Ciencias Biomedicas,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
14 - Peguero Sanchez, Esteban (2017). Prediccion de sitios de entrada internos al ribosoma en eucariontes .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
15 - Oliver Ocano, Patricia Maria Rufina (2017). Desarrollo de una nueva estrategia para la prediccion de sitios de union de factores transcripcionales en bacterias, basado en el analisis de huellas filogeneticas y su caracterizacion biologica : la familia LysR como modelo de estudio.
Centro de Ciencias Genomicas,
Doctorado en Ciencias Biomedicas,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
16 - Estrada Guerra, Karel Johan (2017). Identificación in silico de elementos de regulación en secuencias de organismos bacterianos.
Instituto de Investigacion en Ciencias Basicas y Aplicadas,
Maestría en Ciencias,
UAEM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
17 - Gutierrez Preciado, Ana Lucia (2013). Identificacion de la funcion de los genes a partir de la especificidad del riboswitch t box .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Biomedicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
18 - Taboada Ramirez, Blanca Itzelt (2012). Identificacionin silicode operonesen genomas bacterianos basadaen redes neuronales .
Doctora en Ciencias (Computacion),
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique, Verde Rodarte, Maria Cristina
19 - Quintana Kageyama, Jorge Enrique (2012). Evolucion in silico de interacciones proteina ligando : profilina/polilprolina como modelo de estudio .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
20 - Martinez Nunez, Mario Alberto (2011). Divergencia de los sistemas de regulacion en secuencias paralogas en bacterias : una perspectiva genomica .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
21 - Avila Magana, Viridiana (2011). Identificacion in silico de nuevos sitios de entrada para el ribosoma en genomas eucariontes .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
22 - Avila Magana, Viridiana (2009). Termoriboswitches : moleculas de RNA regulatorias responsivas a temperatura.
Facultad de Ciencias,
Licenciatura en Biología,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
23 - Oliver Ocano, Patricia Maria Rufina (2008). Analisis de operones divergentes conservados en procariontes para la identificacion de potenciales sitios de union a factores transcripcionales.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
24 - Rodriguez Escamilla, Zuemy (2007). Diseno y construccion de riboswitches sinteticos.
Facultad de Ciencias,
Licenciatura en Biología,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
25 - Martinez Nunez, Mario Alberto (2007). Subdivision de grupos COGs con presencia de paralogos en subfamilias de proteinas.
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
26 - Olivares Zavaleta, Norma (2006). Analisis genomico de elementos de curvatura en secuencias promotoras de escherichia coli K12 y su aplicacion al caso de hns.
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
27 - Abreu Goodger, Cei (2005). Senales conservadas en regiones intergenicas bacterianas : riboswitches y mas alla .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
28 - Ontiveros Palacios, Nancy Guadalupe (2004). Identificacion de secuencias de regulacion riboswitches en operaciones de la biosintesis de vitaminas y cofactores.
Facultad de Ciencias,
Licenciatura en Biología,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
29 - Jauregui Sandoval, Ruy (2003). Analisis de la curvatura estatica del DNA genomico .
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias Bioquimicas,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
30 - Cortez Quezada, Diego Claudio (2002). Estudio de las secuencias extragenicas palindromicas repetidas en los genomas procariontes.
Facultad de Ciencias,
Licenciatura en Biología,
UNAM.
*
Asesor: Merino Perez, Enrique
31 - Sampieri Hernandez, Aristides, III (2001). Analisis de la region 5o de regulacion del Gen aprE de basillus subtilis .
Instituto de Biotecnologia,
Maestria en Ciencias (Bioquimica),
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
32 - Abreu Goodger, Cei (2001). Analisis de la distribucion de los sitios de metilacion DAM y DCM en el genoma completo de Escherichia coli y su posible implicacion biologica .
Instituto de Biotecnologia,
Licenciatura en Investigacion Biomedica Basica,
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
33 - Jan Roblero, Janet (2000). Diseno y construccion de cepas de Bacillis subtilis sobreproductoras de proteinas heterologas.
Instituto de Biotecnologia,
Doctorado en Ciencias (Bioquimica),
UNAM.
Asesor: Merino Perez, Enrique
* Indica publicación con otra institución de adscripción
Total de publicaciones: 112
- Tipo
- Fecha
Artículo
34 - Perez-Morales,G., Vara-Coapango,J., Merino,E., Cevallos,M.A., Gosset,G., Martinez,A. (2026). Enhancing the heat tolerance of homolactic Escherichia coli through reverse metabolic engineering.
Applied Microbiology and Biotechnology,
110 (1),
26.
Artículo
35 - Carrera-Reyna,M., Cruz-Flores,E., Merino,E. (2025). Analysis and comparison of the bacterial a54 regulon: Evidence of phylogenetic trends in gene regulation.
PLoS ONE,
20 (8),
e0327805.
Artículo
36 - Morales,N., Merino,E. (2025). Variation in phylogenetic tendencies of contiguous riboswitches.
Microbial Genomics,
11 (9),
001496.
Artículo
37 - Perez-Morales,G., Martinez-Conde,K.V., Caspeta,L., Merino,E., Cevallos,M.A., Gosset,G., Martinez,A. (2025). Thermally adapted Escherichia coli keeps transcriptomic response during temperature upshift exposure.
Applied Microbiology and Biotechnology,
109 (1),
120.
Artículo
38 - Vallejo-Giraldo,A., Fragoso-Jimenez,J.C., Martinez,L.M., Hernandez-Chavez,G., Merino,E., Martinez,A., Corona-Gonzalez,R.I., Marcellin,E., Vieille,C., Gosset,G. (2025). Carbon Assimilation and Regulation by the Phosphotransferase System in Actinobacillus succinogenes.
Journal of Applied Microbiology,
136 (9),
lxaf232.
Artículo
Artículo
40 - Estrada,K., Garciarrubio,A., Merino,E. (2024). Unraveling the Plasticity of Translation Initiation in Prokaryotes: Beyond the Invariant Shine-Dalgarno Sequence.
PLoS ONE,
19 (1),
e0289914.
Artículo
41 - Guadarrama-Perez,V., Aguilar,C., Porras-Sanjuanico,A., Merino,E., Ramirez,O.T., Barona-Gomez,F., Palomares,L.A. (2024). Expression in CHO cells of a bacterial biosynthetic pathway producing a small non-ribosomal peptide aldehyde prevents proteolysis of recombinant proteins.
Metabolic Engineering,
82,
79-88.
Artículo
42 - Guillen-Chable,F., Valdez Iuit,J.O., Avila Castro,L.A., Rosas,C., Merino,E., Rodriguez-Escamilla,Z., Martinez-Nunez,M.A. (2024). Geographical distribution of mobile genetic elements in microbial communities along the Yucatan coast.
PLoS ONE,
19 (4),
e0301642.
Artículo
43 - Perez-Morales,G., Caspeta,L., Merino,E., Cevallos,M.A., Gosset,G., Martinez,A. (2024). Simultaneous saccharification and fermentation for D-lactic acid production using a metabolically engineered Escherichia coli adapted to high temperature.
Biotechnology for Biofuels and Bioproducts,
17 (1),
132.
Artículo
44 - Barcelo-Antemate,D., Fontove-Herrera,F., Santos,W., Merino,E. (2023). The effect of the genomic GC content bias of prokaryotic organisms on the secondary structures of their proteins.
PLoS ONE,
18 (5),
e0285201.
Artículo
45 - Chowdhury-Paul,S., Martinez-Ortiz,I.C., Pando-Robles,V., Moreno,S., Espin,G., Merino,E., Nunez,C. (2023). The Azotobacter vinelandii AlgU regulon during vegetative growth and encysting conditions: A proteomic approach.
PLoS ONE,
18 (11),
e0286440.
Artículo
46 - Rivas-Marin,E., Moyano-Palazuelo,D., Henriques,V., Merino,E., Devos,D.P. (2023). Essential gene complement of Planctopirus limnophila from the bacterial phylum Planctomycetes.
Nature Communications,
14 (1),
7224.
Artículo
47 - Serrano-Gutierrez,M., Merino,E. (2023). Antisense-acting riboswitches: A poorly characterized yet important model of transcriptional regulation in prokaryotic organisms.
PLoS ONE,
18 (2),
e0281744.
Artículo
48 - Loza,A., Garcia-Guevara,F., Segovia,L., Escobar-Zepeda,A., Sanchez-Olmos,M.D.C., Merino,E., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L., Juarez,K., Gutierrez-Rios,R.M. (2022). Definition of the Metagenomic Profile of Ocean Water Samples From the Gulf of Mexico Based on Comparison With Reference Samples From Sites Worldwide.
Frontiers in Microbiology,
12,
781497.
Artículo
49 - Angel-Lerma,L.E., Merino,E., Kwon,O., Medina-Aparicio,L., Hernandez-Lucas,I., Alvarez,A.F., Georgellis,D. (2021). Protein dosage of the lldPRD operon is correlated with RNase E-dependent mRNA processing.
Journal of Bacteriology,
203 (6),
e00555-20.
Artículo
50 - Chavez,J., Devos,D.P., Merino,E. (2021). Complementary tendencies in the use of regulatory elements (transcription factors, sigma factors, and riboswitches) in Bacteria and Archaea.
Journal of Bacteriology,
203 (2),
e00413-20.
Artículo
51 - Tenorio-Salgado,S., Castelan-Sanchez,H.G., Davila-Ramos,S., Huerta-Saquero,A., Rodriguez-Morales,S., Merino-Perez,E., Roa de la Fuente LF, Solis-Pereira,S.E., Perez-Rueda,E., Lizama-Uc,G. (2021). Metagenomic analysis and antimicrobial activity of two fermented milk kefir samples.
Microbiologyopen,
10 (2),
e1183.
Artículo
52 - Raggi,L., Garcia-Guevara,F, Godoy-Lozano,E.E., Martinez-Santana,A., Escobar-Zepeda,A., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Merino,E., Sanchez-Flores,A., Licea-Navarro,A., Pardo-Lopez,L., Segovia,L., Juarez,K. (2020). Metagenomic Profiling and Microbial Metabolic Potential of Perdido Fold Belt (NW) and Campeche Knolls (SE) in the Gulf of Mexico.
Frontiers in Microbiology,
11.
Artículo
53 - Martinez-Amador,P., Castaneda,N., Loza,A., Soto,L., Merino,E., Gutierrez-Rios,R.M. (2019). Prediction of protein architectures involved in the signaling-pathway initiating sporulation in Firmicutes.
BMC Research Notes,
12 (1),
686,
686.
Artículo
54 - Soto-Aceves,M.P., Cocotl-Yanez,M., Merino,E., Castillo-Juarez,I., Cortes-Lopez,H., Gonzalez-Pedrajo,B., Diaz-Guerrero,M., Servin-Gonzalez,L., Soberon-Chavez,G. (2019). Inactivation of the quorum-sensing transcriptional regulators LasR or RhlR does not suppress the expression of virulence factors and the virulence of Pseudomonas aeruginosa PAO1.
Microbiology,
165 (4),
425-432.
Artículo
55 - Escobar-Zepeda, A., Godoy-Lozano, E.E., Raggi, L., Segovia, L., Merino, E., Gutierrez-Rios, R.M., Juarez, K., Licea-Navarro, A.F., Pardo-Lopez, L., Sanchez-Flores, A. (2018). Analysis of sequencing strategies and tools for taxonomic annotation: Defining standards for progressive metagenomics.
Scientific Reports,
8 (1),
12034.
Artículo
56 - Godoy-Lozano,E.E., Escobar-Zepeda,A., Raggi,L., Merino,E., Gutierrez-Rios,R.M., Juarez,K., Segovia,L., Licea-Navarro,A.F., Gracia,A., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L. (2018). Bacterial diversity and the geochemical landscape in the southwestern Gulf of Mexico.
Frontiers in Microbiology,
9 (OCT),
2528.
Artículo
57 - Taboada, B., Estrada, K., Ciria, R., Merino, E. (2018). Operon-mapper: A Web Server for Precise Operon Identification in Bacterial and Archaeal Genomes.
Bioinformatics,
34 (23),
4118?4120.
Artículo
58 - Gutierrez-Preciado, A., Vargas-Chavez, C., Reyes-Prieto, M., Ordonez, O.F., Santos-Garcia, D., Rosas-Perez, T., Valdivia-Anistro, J., Rebollar, E.A., Saralegui, A., Moya, A., Merino, E., Farias, M.E., Latorre, A., Souza, V. (2017). The genomic sequence of Exiguobacterium chiriqhucha str. N139 reveals a species that thrives in cold waters and extreme environmental conditions.
PeerJ,
5,
e3162.
Revisión
59 - Merino, E., Flores-Encarnacion, M., Aguilar-Gutierrez, G.R. (2017). Functional interaction and structural characteristics of unique components of Helicobacter pylori T4SS.
Febs Journal,
284 (21),
3540-3549.
Artículo
60 - Pannier, L., Merino, E., Marchal, K., Collado-Vides, J. (2017). Effect of genomic distance on coexpression of coregulated genes in E. coli.
PLoS ONE,
12 (4),
e0174887.
Artículo
61 - Rodriguez-Mejia, J.L., Roldan-Salgado, A., Osuna, J., Merino, E., Gaytan, P. (2017). A Codon Deletion at the Beginning of Green Fluorescent Protein Genes Enhances Protein Expression.
Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology,
27 (1),
1-10.
Artículo
62 - Vega-Cabrera, L.A., Guerrero, A., Rodriguez-Mejia, J.L., Tabche, M.L., Wood, C.D., Gutierrez-Rios, R.M., Merino, E., Pardo-Lopez, L. (2017). Analysis of Spo0M function in Bacillus subtilis.
PLoS ONE,
12 (2),
e0172737.
Artículo
63 - Zappulo, A., van den, Bruck D., Ciolli, Mattioli C., Franke, V., Imami, K., McShane, E., Moreno-Estelles, M., Calviello, L., Filipchyk, A., Peguero-Sanchez, E., Muller, T., Woehler, A., Birchmeier, C., Merino, E., Rajewsky, N., Ohler, U., Mazzoni, E.O., Selbach, M., Akalin, A., Chekulaeva, M. (2017). RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome.
Nature Communications,
8 (1),
583.
Artículo
64 - Mucito-Varela,E., Castillo-Rojas,G., Cevallos,M.A., Lozano,L., Merino,E., Lopez-Leal,G., Lopez-Vidal,Y. (2016). Complete Genome Sequence of Helicobacter pylori Strain 7C Isolated from a Mexican Patient with Chronic Gastritis.
Genome Announcements,
4 (1).
Artículo
65 - Mucito-Varela,E., Castillo-Rojas,G., Cevallos,M.A., Lozano,L., Merino,E., Lopez-Leal,G., Lopez-Vidal,Y. (2016). Complete Genome Sequence of Helicobacter pylori Strain 29CaP Isolated from a Mexican Patient with Gastric Cancer.
Genome Announcements,
4 (1).
Artículo
66 - Oliver,P., Peralta-Gil,M., Tabche,M.L., Merino,E. (2016). Molecular and structural considerations of TF-DNA binding for the generation of biologically meaningful and accurate phylogenetic footprinting analysis: the LysR-type transcriptional regulator family as a study model.
BMC Genomics,
17,
686.
Artículo
67 - Rodriguez-Escamilla,Z., Martinez-Nunez,M.A., Merino,E. (2016). Epigenetics knocks on synthetic biology's Door.
Fems Microbiology Letters,
363 (17),
fnw191.
Artículo
68 - Camacho,M.I., Alvarez,A.F., Gonzalez-Chavez,R.G., Romeo,T., Merino,E., Georgellis,D. (2015). Effects of the global regulator CsrA on the BarA/UvrY two-component signaling system.
Journal of Bacteriology,
197 (5),
983-991.
Artículo
69 - Gutierrez-Preciado,A., Torres,A.G., Merino,E., Bonomi,H.R., Goldbaum,F.A., Garcia-Angulo,V.A. (2015). Extensive Identification of Bacterial Riboflavin Transporters and Their Distribution across Bacterial Species.
PLoS ONE,
10 (5),
e0126124.
Artículo
70 - Moran,J., Ramirez,G., Jimenez,L., Cruz,A., Perez-Patrigeon,S., Hidalgo,A., Orozco,L., Martinez,A., Padilla,L., Avila-Moreno,F., Cabello,C., Granados,J., Ortiz-Quintero,B., Ramirez-Venegas,A., Ruiz-Palacios,G.M., Zlotnik,A., Merino,E., Zuniga,J. (2015). Circulating levels of miR-150 are associated with poorer outcomes of A/H1N1 infection.
Experimental and Molecular Pathology,
99 (2),
253-261.
Artículo
71 - Peguero-Sanchez,E., Pardo-Lopez,L., Merino,E. (2015). IRES-dependent translated genes in fungi: computational prediction, phylogenetic conservation and functional association.
BMC Genomics,
16 (1),
1059.
Artículo
72 - Grosso-Becerra,M.V., Croda-Garcia,G., Merino,E., Servin-Gonzalez,L., Mojica-Espinosa,R., Soberon-Chavez,G. (2014). Regulation of Pseudomonas aeruginosa virulence factors by two novel RNA thermometers.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,
111 (43),
15562-15567.
Artículo
73 - Barraza,A., Estrada-Navarrete,G., Rodriguez-Alegria,M.E., Lopez-Munguia,A., Merino,E., Quinto,C., Sanchez,F. (2013). Down-regulation of PvTRE1 enhances nodule biomass and bacteroid number in the common bean.
New Phytologist,
197 (1),
194-206.
Artículo
74 - Freyre-Gonzalez,J.A., Manjarrez-Casas,A.M., Merino,E., Martinez-Nunez,M., Perez-Rueda,E., Gutierrez-Rios,R.M. (2013). Lessons from the modular organization of the transcriptional regulatory network of Bacillus subtilis.
BMC Systems Biology,
7 (1),
127.
Artículo
75 - Gutierrez-Preciado,A., Merino,E. (2012). Elucidating metabolic pathways and digging for genes of unknown function in microbial communities: the riboswitch approach.
Clinical Microbiology and Infection,
18 Suppl 4,
35-39.
Artículo
76 - Taboada,B., Ciria,R., Martinez-Guerrero,C.E., Merino,E. (2012). ProOpDB: Prokaryotic Operon DataBase.
Nucleic Acids Research,
40 (1),
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Laboratorio +52 (777) 329-1634
desde la CDMX 562-27634
Red UNAM 27634 -
Laboratorio +52 (777) 329-1629
desde la CDMX 562-27629
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