Dr. Fidel Alejandro Sanchez Flores

Dr. Fidel Alejandro Sanchez Flores
Investigador Titular B Tiempo Completo
Departamento de Microbiología Molecular

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Líneas Investigación

Bioinformática aplicada a las ciencias ómicas

Genómica y transcriptomica de patógenos y parásitos

Microbiología Ambiental

Proyectos

Número de registros: 4

Activos
Vencidos

1900

Bacterias marinas con potencial para degradar plásticos, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 1900
Reacreditación laboratorio nacional de apoyo tecnológico de las ciencias genómicas "lnatcg", CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 1900

2025

Local pathogen portal in mexico, Swiss Institute of Bioinformatics, 2025

2017

genómica y transcriptómica del isópodo parásito cymothoa exigua, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2017 - 2019

Grado Académico

Doctorado, Ciencias Bioquímicas, IBT-UNAM (2007) con especialidad en Bioinformática
Licenciatura, Investigación Biomédica Básica, IIB-UNAM (2001)

Estudiantes

Activos
Graduados

Doctorado

Magali Yazmin Galicia Ortiz
Transcriptómica comparativa y evaluación de potenciales blancos en el Adenocarcinoma Ductal Pancreático
Ilani Yahel Godínez Bautista
Predicción, caracterización y función de RNAs largos no codificantes en Babesia spp. durante el proceso de invasión a glóbulos rojos
M. C. Rebeca Gonzalez Ortiz
Transcriptómica comparativa de la respuesta farmacológica al compuesto az5363 en dos líneas celulares de adenocarcinoma ductal humano.

Estancia Temporal

Gabriela Celis Vázquez

1 - Godinez Bautista, Ilani Yahel (2025). Analisis y caracterizacion de long non-coding rnas en litopenaeus vannamei. Instituto de Biotecnologia, Maestria en Ciencias Bioquimicas, UNAM.

Asesor: Sanchez Flores, Fidel Alejandro

2 - Martinez Noriega, Mariana (2024). Caracterizacion del perfil taxonomico de los tapetes microbianos como posibles bioindicadores de la salud del manglar en Guadalupe, Francia. Instituto de Biotecnologia, Maestria en Ciencias Bioquimicas, UNAM.

Asesor: Sanchez Flores, Fidel Alejandro

3 - Sanchez Fragoso, Jose Santiago (2020). Desarrollo de software para prediccion y caracterizacion in silico de peptidos antimicrobianos en diferentes organismos . Instituto de Biotecnologia, Maestria en Ciencias Bioquimicas, UNAM.

Asesor: Sanchez Flores, Fidel Alejandro

4 - Flores Rodriguez, Ramon Arnulfo (2017). Identificacion asistida por computadora de dominios funcionales y su evolucion en proteinas. FES Acatlan, Licenciatura en Matematicas Aplicadas y Computacion, UNAM. *

Asesor: Sanchez Flores, Fidel Alejandro

Publicaciones

* Indica publicación con otra institución de adscripción

Total de publicaciones: 176

Tipo
Fecha

Artículos

Artículo

5 - Taboada,B., Zarate,S., Munoz-Medina,J.E., Sanchez-Flores,A., Herrera-Estrella,A., Gomez-Gil,B., Vazquez-Perez,J.A., Salas-Lais,A.G., Zarate,A., Arias,C.F. (2026). Genomic Diversity and Geographic Distribution of SARS-CoV-2 in Mexico: Insights From 4 Years of Genomic Surveillance. Archives of Medical Research, 57 (2), 103289.

Artículo

6 - Calderon-Ezquerro,M.C., Brunner-Mendoza,C., Guerrero-Guerra,C., Sanchez-Flores,A., Salinas-Peralta,I., Toriello,C., Ponce de Leon,A., Ortega-Rosas,C.I. (2025). Genetic sequencing of the airborne fungal spectrum and air quality at a public hospital in Mexico City. PLOS Global Public Health, 5 (6), e0004784.

Artículo

7 - Lopez-Teros,M., Avila-Galicia,K.E., Librado-Osorio,R., Jimenez-Jacinto,V., Garcia-Alvarez,J.A., Hernandez-Montes,G., Sanchez-Flores,A., Alarcon-Aguilar,A., Luna-Lopez,A., Konigsberg,M. (2025). Palmitate-Induced Primary Rat Senescent Astrocytes Exhibit Higher Inflammatory Activity and a Distinct Transcriptomic Profile Compared to Reactive Astrocytes. Journal of Neurochemistry, 169 (7), e70164.

Artículo

8 - Martinez-Garcia,G., Estrada,K., Lira-Amaya,J.J., Santamaria-Epinosa,R.M., Lopez-Arellano,M.E., Sciutto-Conde,E.L., Rojas-Martinez,C., Alvarez-Martinez,J.A., Sanchez-Flores,A., Figueroa-Millan,J.V (2025). Comparative Analysis of Immune Response Genes Induced by a Virulent or Attenuated Strain of Babesia bigemina. International Journal of Molecular Sciences, 26 (2), 487.

Artículo

9 - Soto-Hernandez,A., Muriel-Millan,L.F., Gracia,A., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L. (2025). Enzymatic characterization and polyurethane biodegradation assay of two novel esterases isolated from a polluted river. PLoS ONE, 20 (7), e0327637.

Artículo

10 - Zarate,S., Taboada,B., Torres-Rivera,K., Bautista-Carbajal,P., Garcia-Leon,M.L., Tabla-Orozco,V., Juarez-Tobias,M.S., Noyola,D.E., Martinez-Arce,P.A., Espinosa-Sotero,M.D., Martinez-Aguilar,G., Rojas-Larios,F., Sanchez-Flores,A., Arias,C.F., Wong-Chew,R.M. (2025). Circulation of RSV Subtypes A and B Among Mexican Children During the 2021-2022 and 2022-2023 Seasons. Pathogens, 14 (10), 996.

Artículo

11 - Brunner-Mendoza,C., Calderon-Ezquerro,M.C., Guerrero-Guerra,C., Sanchez-Flores,A., Salinas-Peralta,I., Toriello,C. (2024). Diversity and Composition of the Airborne Fungal Community in Mexico City with a Metagenomic Approach. Microorganisms, 12 (12), 2632.

Artículo

12 - Calderon-Ezquerro,M.C., Ponce de Leon,A.A., Brunner-Mendoza,C., Guerrero-Guerra,C.C., Sanchez-Flores,A., Salinas-Peralta,I., Lopez-Jacome,L.E., Colin-Castro,C.A, Martinez-Zavaleta,M.G. (2024). Assessment of airborne bacteria from a public health institution in Mexico City. PLOS Global Public Health, 4 (11), e0003672.

Artículo

13 - Embarcadero-Jimenez,S., Araujo-Palomares,C.L., Moreno-Perlin,T., Ramirez-Alvarez,N., Quezada-Hernandez,C., Batista-Garcia,R.A., Sanchez-Flores,A., Calcaneo-Hernandez,G., Silva-Jimenez,H. (2024). Physiology and comparative genomics of the haloalkalitolerant and hydrocarbonoclastic marine strain Rhodococcus ruber MSA14. Archives of Microbiology, 206 (7), 328.

Artículo

14 - Garcia-Lopez,R., Taboada,B., Zarate,S., Munoz-Medina,J.E., Salas-Lais,A.G., Herrera-Estrella,A., Boukadida,C., Vazquez-Perez,J.A., Gomez-Gil,B., Sanchez-Flores,A., Arias,C.F. (2024). Exploration of low-frequency allelic variants of SARS-CoV-2 genomes reveals coinfections in Mexico occurred during periods of VOCs turnover. Microbial Genomics, 10 (3), 001220.

Artículo

15 - Millan-Lopez,S., Zurita-Artaloitia,J.M., Silva-Jimenez,H., Pardo-Lopez,L., Sanchez-Flores,A. (2024). Genomic sequence of three hydrocarbonoclastic pseudomonadaceae strains isolated from marine sediments of the port of Rosarito, Baja California, Mexico. Microbiology Resource Announcements, 13 (7), e0033524.

Artículo

16 - Rojas-Vargas,J., Rebollar,E.A., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L. (2024). A comparative genomic study of a hydrocarbon-degrading marine bacterial consortium. PLoS ONE, 19 (8), e0303363.

Artículo

17 - Santamaria,R.M., Estrada,K., Lopez,M.E., Rojas,E., Martinez,G., Alcala,Y., Rojas,C., Alvarez,J.A., Lira,J.J., Santamaria,T.V., Sanchez-Flores,A., Figueroa,J.V. (2024). Comparative Transcriptome Analysis of Babesia bigemina Attenuated Vaccine and Virulent Strains of Mexican Origin. Vaccines (Basel), 12 (3), 309.

Artículo

18 - Singh,P., Vydyam,P., Fang,T., Estrada,K., Gonzalez,L.M., Grande,R., Kumar,M., Chakravarty,S., Berry,V., Ranwez,V., Carcy,B., Depoix,D., Sanchez,S., Cornillot,E., Abel,S., Ciampossin,L., Lenz,T., Harb,O., Sanchez-Flores,A., Montero,E., Le Roch,K.G., Lonardi,S., Mamoun,C.B. (2024). Insights Into the Evolution, Virulence and Speciation of Babesia MO1 and Babesia divergens Through Multiomics Analyses. Emerging Microbes and Infections, 13 (1), 2386136.

Artículo

19 - Castelan-Sanchez,H.G., Delaye,L., Inward,R.P.D., Dellicour,S., Gutierrez,B., Martinez de la Vina,N., Boukadida,C., Pybus,O.G., de Anda Jauregui,G., Guzman,P., Flores-Garrido,M., Fontanelli,O., Hernandez-Rosales,M., Meneses,A., Olmedo-Alvarez,G., Herrera-Estrella,A., Sanchez-Flores,A., Munoz-Medina,J.E., Comas-Garcia,A., Gomez-Gil,B., Zarate,S., Taboada,B., Lopez,S., Arias,C.F., Kraemer,M.U.G., Lazcano,A., Escalera-Zamudio,M. (2023). Comparing the evolutionary dynamics of predominant SARS-CoV-2 virus lineages co-circulating in Mexico. Elife, 12, e82069.

Artículo

20 - Garcia-Lopez,R., Rivera-Gutierrez,X., Rosales-Rivera,M., Zarate,S., Munoz-Medina,J.E., Roche,B., Herrera-Estrella,A., Gomez-Gil,B., Sanchez-Flores,A., Taboada,B., Arias,C.F. (2023). SARS-CoV-2 BW lineage, a fast-growing Omicron variant from southeast Mexico bearing relevant escape mutations. Infection, 51, 1549-1555.

Artículo

21 - Geiger,O., Sanchez-Flores,A., Padilla-Gomez,J., Degli-Esposti M. (2023). Multiple approaches of cellular metabolism define the bacterial ancestry of mitochondria. Science Advances, 9 (32), eadh0066.

Artículo

22 - Loza,A., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., Zarate,S., Lopez,S., Ciria,R., Palomares,D., Garcia-Lopez,R., Isa,P., Taboada,B., Rosales,M., Boukadida,C., Herrera-Estrella,A., Mojica,N.S., Rivera-Gutierrez,X., Munoz-Medina,J.E., Salas-Lais,A.G., Sanchez-Flores,A., Vazquez-Perez,J.A., Arias,C.F., Gutierrez-Rios,R.M. (2023). Two-year follow-up of the COVID-19 pandemic in Mexico. Frontiers in Public Health, 10, 1050673.

Articulo

23 - Murga-Garrido,S.M., Ulloa-Perez,E.J., Diaz-Benitez,C.E, Orbe-Orihuela,Y.C, Cornejo-Granados,F., Ochoa-Leyva,A, Sanchez-Flores,A, Cruz,M, Castaneda-Marquez,A.C, Plett-Torres,T, Burguete-Garcia,A.I., Lagunas-Martinez,A. (2023). Virulence Factors of the Gut Microbiome Are Associated with BMI and Metabolic Blood Parameters in Children with Obesity. Microbiology Spectrum, 11 (2), e0338222.

Artículo

24 - Nabor-Romero,O., Zavaleta-Mejia,E., Ochoa-Martinez,D.L., Silva-Valenzuela,M., Vega-Arreguin,J., Sanchez-Flores,A., Rojas-Martinez,R.I (2023). Transcriptional alterations induced by Nacobbus aberrans in interaction with chili pepper CM-334 and Phytophthora capsici. Physiological and Molecular Plant Pathology, 123, 101942.

Artículo

25 - Rojas-Vargas,J., Adaya,L., Lacerda,A.L., Pedrotti,M.-L., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L. (2023). Draft genome sequences of six bacteria isolated from polylactic acid samples from the Mediterranean Sea. Microbiology Resource Announcements, 12 (11), e0079423.

Artículo

26 - Singh,P., Lonardi,S., Liang,Q., Vydyam,P., Khabirova,E., Fang,T., Gihaz,S., Thekkiniath,J., Munshi,M., Abel,S., Ciampossin,L., Batugedara,G., Gupta,M., Lu,X.M., Lenz,T., Chakravarty,S., Cornillot,E., Hu,Y., Ma,W., Gonzalez,L.M., Sanchez,S., Estrada,K., Sanchez-Flores,A., Montero,E., Harb,O.S., Le Roch,K.G., Mamoun,C.B. (2023). Babesia duncani multi-omics identifies virulence factors and drug targets. Nature Microbiology, 8 (5), 845-859.

Artículo

27 - Taboada,B.I., Zarate,S., Garcia-Lopez,R., Munoz-Medina,J.E., Gomez-Gil,B., Herrera-Estrella,A., Sanchez-Flores,A., Salas-Lais,A.G., Roche,B., Martinez-Morales,G., Dominguez-Zarate,H., Duque-Molina,C., Aviles-Hernandez,R., Lopez,S., Arias,C.F. (2023). SARS-CoV-2 Omicron variants BA.4 and BA.5 dominated the fifth COVID-19 epidemiological wave in Mexico. Microbial Genomics, 9 (12), 001120.

Artículo

28 - Velasquez C,L.F., Canton,P.E., Sanchez-Flores,A., Soberon,M., Bravo,A., Ceron S,J.A. (2023). Identification of Cry toxin receptor genes homologs in a de novo transcriptome of Premnotrypes vorax (Coleoptera: Curculionidae). PLoS ONE, 18 (9), e0291546.

Artículo

29 - Zarate,S., Taboada,B., Rosales-Rivera,M., Garcia-Lopez,R., Munoz-Medina,J.E., Sanchez-Flores,A., Herrera-Estrella,A., Gomez-Gil,B., Selem-Mojica N., Salas-Lais,A.G., Vazquez-Perez,J.A., Cabrera-Gaytan,D.A., Fernandes-Matano,L., Uribe-Noguez,L.A., Chale-Dzul,J.B., Maldonado Meza,B.I., Mejia-Nepomuceno,F., Perez-Padilla,R., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A, Roche,B, Lopez,S, Arias,C.F (2023). Omicron-BA.1 Dispersion Rates in Mexico Varied According to the Regional Epidemic Patterns and the Diversity of Local Delta Subvariants. Viruses, 15 (1), 243.

Artículo

30 - Bobes,R.J., Estrada,K., Rios-Valencia,D.G., Calderon-Gallegos,A., de la Torre,P., Carrero,J.C., Sanchez-Flores,A., Laclette,J.P. (2022). The Genomes of Two Strains of Taenia crassiceps the Animal Model for the Study of Human Cysticercosis. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 12, 876839.

Artículo

31 - Boukadida,C., Taboada,B., Escalera-Zamudio,M., Isa,P., Ramirez-Gonzalez,J.E., Vazquez-Perez,J.A., Munoz-Medina,J.E., Grajales-Muniz,C., Gonzalez-Torres,C., Gaytan-Cervantes,F.J., Rincon-Rubio,A., Matias-Florentino,M., Paz-Juarez,H.E., Sanchez-Flores,A., Mendieta-Condado,E., Barrera-Badillo,G., Hernandez-Rivas,L., Lopez,S., Lopez-Martinez,I, Avila-Rios,S., Arias,C.F. (2022). Genomic Characterization of SARS-CoV-2 Isolated from Patients with Distinct Disease Outcomes in Mexico. Microbiology Spectrum, 10 (1), e01249-21.

Artículo

32 - Corona-Herrera,G.A., Navarrete-Ramirez,P., Sanchez-Flores,F.A., Jimenez-Jacinto,V., Martinez-Palacios,C.A., Palomera-Sanchez,Z., Volkoff,H., Martinez-Chavez,C.C. (2022). Shining light on the transcriptome: Molecular regulatory networks leading to a fast-growth phenotype by continuous light in an environmentally sensitive teleost (Atherinopsidae). Journal of photochemistry and photobiology.B, Biology, 235, 112550.

Revisión

33 - Garcia-Lopez,R., Laresgoiti-Servitje,E., Lemus-Martin,R., Sanchez-Flores,A., Sanders-Velez,C. (2022). The New SARS-CoV-2 Variants and Their Epidemiological Impact in Mexico. MBio, 13 (5), e0106021.

Artículo

34 - Isa,P., Taboada,B., Garcia-Lopez,R., Boukadida,C., Ramirez-Gonzalez,J.E., Vazquez-Perez,J.A., Hernandez-Teran,A., Romero-Espinoza,J.A., Munoz-Medina,J.E., Grajales-Muniz,C., Rincon-Rubio,A., Matias-Florentino,M., Sanchez-Flores,A., Mendieta-Condado,E., Barrera-Badillo,G., Lopez,S., Hernandez-Rivas,L., Lopez-Martinez,I., Avila-Rios,S., Arias,C.F. (2022). Metagenomic analysis reveals differences in the co-occurrence and abundance of viral species in SARS-CoV-2 patients with different severity of disease. BMC Infectious Diseases, 22 (1), 792.

Artículo

35 - Loza,A., Garcia-Guevara,F., Segovia,L., Escobar-Zepeda,A., Sanchez-Olmos,M.D.C., Merino,E., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L., Juarez,K., Gutierrez-Rios,R.M. (2022). Definition of the Metagenomic Profile of Ocean Water Samples From the Gulf of Mexico Based on Comparison With Reference Samples From Sites Worldwide. Frontiers in Microbiology, 12, 781497.

Artículo

36 - Murga-Garrido,S.M., Orbe-Orihuela,Y.C., Diaz-Benitez,C.E., Castaneda-Marquez,A.C., Cornejo-Granados,F., Ochoa-Leyva,A., Sanchez-Flores,A., Cruz,M., Burguete-Garcia,A.I., Lagunas-Martinez,A. (2022). Alterations of the Gut Microbiome Associated to Methane Metabolism in Mexican Children with Obesity. Children, 9 (2), 148.

Artículo

37 - Nabor-Romero,O., Rojas-Martinez,R.I., Zavaleta-Mejia,E., Vega-Arreguin,J., Ochoa-Martinez,D., Sanchez-Flores,A., Romo-Castillo,M. (2022). Transcriptomic Analysis of the CM-334/P. capsici/N. aberrans Pathosystem to Identify Components in Plant Resistance and Resistance-Breaking Responses. International Journal of Plant Biology, 13 (2), 151-162.

Artículo

38 - Orbe-Orihuela,Y.C., Godoy-Lozano,E.E., Lagunas-Martinez,A, Castaneda-Marquez,A.C, Murga-Garrido,S, Diaz-Benitez,C.E, Ochoa-Leyva,A., Cornejo-Granados,F, Cruz,M, Estrada,K, Bermudez-Morales,V.H., Sanchez-Flores,A., Burguete-Garcia,A.I (2022). Association of Gut Microbiota with Dietary-dependent Childhood Obesity. Archives of Medical Research, 53 (4), 407-415.

Carta nacional

39 - Perelman,C., Fastlicht,A., Sanchez-Flores,A., Wegman-Ostrosky,T. (2022). Superspreading event of Covid-19 in adolescents: is there a difference between the vaccinated and the unvaccinated?. Salud Publica de Mexico, 64 (5, sept-oct), 446-447.

Artículo

40 - Rojas-Vargas, J., Adaya,L., Silva-Jimenez,H., Licea-Navarro, A.F., Sanchez-Flores, A., Gracia,A., Pardo-Lopez,L. (2022). Oil-degrading bacterial consortium from Gulf of Mexico designed by a factorial method, reveals stable population dynamics . Frontiers in Marine Science, 9, 962071.

Artículo

41 - Rojas-Vargas,J., Gonzalez-Sanchez,R., Sanchez-Flores,A., Licea-Navarro,A.F., Pardo-Lopez,L. (2022). Complete Genome Sequence of Halopseudomonas aestusnigri Strain GOM5, Isolated from Asphalt Marine Sediments of the Gulf of Mexico. Microbiology Resource Announcements, 11 (4), e0122221.

Artículo

42 - Sanchez-Correa,M.D.S., Isidra-Arellano,M.C., Pozas-Rodriguez,E.A., Reyero-Saavedra,M.D.R., Morales-Salazar,A., Del Castillo,S.M.L., Sanchez-Flores,A., Jimenez-Jacinto,V., Reyes,J.L., Formey,D., Valdes-Lopez,O. (2022). Argonaute5 and its associated small RNAs modulate the transcriptional response during the rhizobia-Phaseolus vulgaris symbiosis. Frontiers in Plant Science, 13, 1034419.

Artículo

43 - Sanchez-Reyes,A., Breton-Deval,L., Mangelson,H., Salinas-Peralta,I., Sanchez-Flores,A. (2022). Hi-C deconvolution of a textile dye-related microbiome reveals novel taxonomic landscapes and links phenotypic potential to individual genomes. International Microbiology, 25, 99-110.

Artículo

44 - Taboada,B., Zarate,S., Garcia-Lopez,R., Munoz-Medina,J.E., Sanchez-Flores,A., Herrera-Estrella,A., Boukadida,C., Gomez-Gil,B., Selem-Mojica N., Rosales-Rivera,M., Salas-Lais,A.G., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Rivera-Gutierrez,X., Vazquez-Perez,J.A., Avila-Rios,S., Hurtado,J.M., Herrera-Najera,C.I., Nunez-Contreras,J.J., Sarquiz-Martinez,B, Garcia-Arias,V.E., Santiago-Mauricio,M.G., Martinez-Miguel,B., Enciso-Ibarra,J., Chaidez-Quiroz,C., Isa,P., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., Lopez,S., Arias,C.F. (2022). Dominance of Three Sublineages of the SARS-CoV-2 Delta Variant in Mexico. Viruses, 14 (6), 1165.

Artículo

45 - Vazquez-Chacon,C.A., Rodriguez-Gaxiola,F.J., Sanchez-Flores,A., Montano,S., Bello-Rios,C., Fonseca-Coronado,S., Lopez-Carrera,C.F., Martinez-Guarneros,A., Parra-Unda,R., Garcia-Magallanes,N., Arambula-Meraz,E., Escobar-Gutierrez,A., Cruz-Rivera,M., Lopez-Duran,P.A. (2022). Intra-host genetic population diversity: Role in emergence and persistence of drug resistance among Mycobacterium tuberculosis complex minor variants. Infection, Genetics and Evolution, 101, 105288.

Artículo

46 - Zarate,S., Taboada,B., Munoz-Medina,J.E., Isa,P., Sanchez-Flores,A., Boukadida,C., Herrera-Estrella,A., Selem-Mojica N., Rosales-Rivera,M., Gomez-Gil,B., Salas-Lais,A.G., Santacruz-Tinoco,C.E., Montoya-Fuentes,H., ALvarado-Yaah,J.E., Molina-Salinas,G.M., Espinoza-Ayala,G.E., Enciso-Moreno,J.A., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Moreno-Contreras,J., Garcia-Lopez,R., Rivera-Gutierrez,X., Comas-Garcia,A., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., del Angel,R.M., Vazquez-Perez,J.A., Matias-Florentino,M., Perez-Garcia,M., Avila-Rios,S., Castelan-Sanchez,H.G., Delaye,L., Martinez-Castilla,L.P., Escalera-Zamudio,M., Lopez,S., Arias,C.F. (2022). The Alpha Variant (B.1.1.7) of SARS-CoV-2 Failed to Become Dominant in Mexico. Microbiology Spectrum, 10 (2), e0224021.

Artículo

47 - Arevalos-Sanchez,M.M., Maynez-Perez,A.O., Rodriguez-Almeida,F.A., Martinez-Quintana,J.A., Sanchez-Flores,F.A., Felix-Portillo,M., Chavez-Martinez,A., Olvera-Garcia,M.E., Ruiz-Barrera,O., Corral-Luna,A. (2021). In vitro assessment of two novel Cellulases from Trabulsiella odontotermitis for agricultural waste utilization. BMC Biotechnology, 21 (1), 26.

Artículo

48 - Barona-Gomez,F., Delaye,L., Diaz-Valenzuela,E., Plisson,F., Cruz-Perez,A., Diaz-Sanchez,M., Garcia-Sepulveda,C.A., Sanchez-Flores,A., Perez-Abreu,R., Valencia-Valdespino,F.J., Vega-Megana,N., Munoz-Valle,J.F., Garcia-Gonzalez,O.P., Bernal-Silva,S., Comas-Garcia,A., Cibrian-Jaramillo,A. (2021). Phylogenomics and population genomics of SARS-CoV-2 in Mexico during the pre-vaccination stage reveals variants of interest B.1.1.28.4 and B.1.1.222 or B.1.1.519 and the nucleocapsid mutation S194L associated with symptoms. Microbial Genomics, 7 (11), 000684.

Artículo

49 - Escobar-Zepeda,A., Rosas-Escobar,P., Marquez-Valdelamar,L., de la Torre,P., Partida-Martinez,L.P., Remegaldo,R., Sanchez-Flores,A., Vergara,F. (2021). Distinctive prokaryotic microbiomes in sympatric plant roots from a Yucatan cenote. BMC Research Notes, 14 (1), 333.

Artículo

50 - Fajardo-Rebollar,E., Estrada,K., Grande,R., Ek Ramos,M.J., Ruiz-Vargas,G., Villegas-Torres,O.G., Juarez,A., Sanchez-Flores,A., Diaz-Camino,C. (2021). Bacterial and fungal microbiome profiling in chilhuacle negro chili (Capsicum annuum L.) associated with fruit rot disease. Plant Disease, 105 (9).

Artículo

51 - Mora-Gonzalez,P.C., Espinosa-Luna,G., Ramirez-Higuera,A., Pena-Montes,C., Valerio-Alfaro,G., Sanchez-Flores,A, Quintana-Castro,R., Sanchez-Otero,M.G., Oliart-Ros,R.M. (2021). Metagenomic Approach to Bacterial Diversity and Lipolytic Enzyme's Genes from a Steam Soil of Los Humeros Geothermal Field (Puebla, México). Geomicrobiology Journal, 38 (4), 304-314.

artículo

52 - Orta,A.H., Bush,S.J., Gutierrez-Mariscal,M., Castro-Obregon,S., Jaimes-Hoy,L., Grande,R., Vazquez,G., Gorostieta-Salas,E, Martinez-Pacheco,M., Diaz-Barba,K., Cornejo-Paramo,P., Sanchez,A., Tzekely,T., Urrutia,A.O., Cortez,D. (2021). Rats exhibit age-related mosaic loss of chromosome Y. Communications Biology, 4, 1418.

Artículo

53 - Rodriguez-Maldonado,A.P., Vazquez-Perez,J.A., Cedro-Tanda,A., Taboada,B., Boukadida,C., Wong-Arambula,C., Nunez-Garcia,T.E., Cruz-Ortiz,N., Barrera-Badillo,G., Hernandez-Rivas L., Lopez-Martinez,I., Mendoza-Vargas,A., Reyes-Grajeda,J.P., Alcaraz,N., Penaloza-Figueroa,F., Gonzalez-Barrera,D., Rangel-DeLeon,D., Herrera-Montalvo,L.A., Mejia-Nepomuceno,F., Hernandez-Teran,A., Mujica-Sanchez,M., Becerril-Vargas,E., Martinez-Orozco,J.A., Perez-Padilla,R., Salas-Hernandez,J., Sanchez-Flores,A., Isa,P., Matias-Florentino,M., Avila-Rios,S., Munoz-Medina,J.E., Grajales-Muniz,C., Salas-Lais,A.G., Santos Coy-Arechavaleta,A., Hidalgo-Miranda,A., Arias,C.F., Ramirez-Gonzalez,J.E. (2021). Emergence and spread of the potential variant of interest (VOI) B.1.1.519 of SARS-CoV-2 predominantly present in Mexico. Archives of Virology, 166, 3173-3177.

Artículo

54 - Taboada-Ramirez,B., Zarate,S., Isa,P., Boukadida,C., Vazquez-Perez,J.A., Munoz-Medina,J.E., Ramirez-Gonzalez,J.E., Comas-Garcia,A., Grajales-Muniz,C., Rincon-Rubio,A., Matias-Florentino,M., Sanchez-Flores,A., Mendieta-Condado,E., Verleyen,J., Barrera-Badillo,G., Hernandez-Rivas,L., Mejia-Nepomuceno,F., Martinez-Orozco,J.A., Becerril-Vargas,E., Lopez,S., Lopez-Martinez,I., Avila-Rios,S., Arias,C.F. (2021). Genetic Analysis of SARS-CoV-2 Variants in Mexico during the First Year of the COVID-19 Pandemic. Viruses, 13 (11), 2161.

Artículo

55 - Valencia-Morales,M.D.P., Sanchez-Flores,A., Colin-Castelan,D., Alvarado-Caudillo,Y., Fragoso-Bargas,N., Lopez-Gonzalez,G., Pena-Lopez,T., Ramirez-Nava,M., de la Rocha,C., Rodriguez-Rios,D., Lund,G., Zaina,S. (2021). Somatic genetic mosaicism in the apolipoprotein E-null mouse aorta. Thrombosis and Haemostasis, 121 (11), 1541-1553.

Artículo

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Capítulos

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Internacional

117 - Gonzalez,L.M., Sevilla,E., Fernandez-Garcia,M., Sanchez-Flores,A., Montero,E. (2021). Integration of Genomic and Transcriptomic Data to Elucidate Molecular Processes in Babesia divergens. Parasite Genomics. Methods in Molecular Biology vol 2369, 199-215.

Memoria in extenso

118 - Nabor-Romero,O., Rojas-Martinez,R.I., Zavaleta-Mejia,E., Ochoa-Martinez,D.L., Sanchez-Flores,F.A., Vega-Arreguin,J. (2018). Análisis del transcriptoma de chile cm-334 en el rompimiento de resistencia a Phytophthora capsici por Nacobbus aberrans. Memoria del Simposio Avances de Investigación Posgrado en Fitosanidad Colegio de Postgraduados 22 agosto 2018. 89-94, Chapingo: Colegio de Posgraduados.

Nacional

119 - Sanchez-Flores,F. (2016). Secuenciacion masiva en la era genomica. Genómica estructural y funcional en las enfermedades multifactoriales. Mexico: Leea Editorial.

Libros

Libro nacional

120 - Gutierrez-Rios,R.M., Juarez-Lopez,K., Loza-Roman,J.A., Merino-Perez,E., Pardo-Lopez,L., Sanchez-Flores,F.A., Segovia-Forcella,L.P., CICESE, CINVESTAV (2021). Atlas de línea base ambiental del Golfo de México.Tomo X. Distribución de bacterias. .

Otras publicaciones

Preprint

121 - Ozubek,S., Sanchez-Flores,A., Montero,E., Alzan,H., Suarez,C., Grande,R., Gil-Iglesias,A., Bastos,R., Aktas,M., Gonzalez,L.M. (2025). Comparative analysis of the EF-1Iñ Intergenic Region in Babesia divergens isolates: Insights into TA Repeat Variation and Potential Regulatory Implications. bioRxiv, Preprint posted August 11.

Nacional divulgación

122 - Sanchez-Flores,A. (2025). Los logros científicos y tecnológicos más importantes del 2024. La Unión de Morelos, 6 enero.

nacional divulgación

123 - Sanchez-Flores,F.A. (2025). La marca del Bienestar: revisitando las políticas del siglo XX. Union de Morelos, 12 de junio.

Nacional divulgación

124 - Sanchez-Flores,F.A. (2025). Las políticas para el impulso del ecosistema 'Pharma' en México: ¿Cuáles pueden ser los resultados esperados?. La Unión de Morelos, 11 de junio.

Nacional divulgación

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128 - Sanchez-Flores,A. (2024). Los logros científicos y tecnológicos más importantes del 2023 (primera parte). La Unión de Morelos, 02 de enero.

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129 - Sanchez-Flores,A. (2024). Los logros científicos y tecnológicos más importantes del 2023 (segunda parte). La Unión de Morelos, 08 de enero.

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130 - Singh,P., Vydyam,P., Fang,T., Kumar,M., Estrada,K., Grande,R., Sanchez-Flores,A., Gonzalez,L.M., Montero,E., Chakravarty,S., Lonardi,S., Berry,V,, Ranwez,V., Carcy,B., Depoix,D., Sanchez,S., Cornillot,E., Abel,S., Ciampossin,L., Lenz,T., Le Roch,K.G., Harb,O.S., Ben Mamoun,C. (2024). Multiomics analysis reveals B. MO1 as a distinct Babesia species and provides insights into its evolution and virulence. bioRxiv, Preprint posted January 18.

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133 - Taboada,B., Zarate,S., Garcia-Lopez,R., Munoz-Medina,J., Gomez-Gil,B., Herrera-Estrella,A., Sanchez-Flores,A., Salas-Lais,A.G., Roche,B., Martinez-Morales,G., Dominguez-Zarate,H., Duque-Molina,C., Aviles-Hernandez,R., Lopez,S., Arias,C.F. (2023). SARS-CoV-2 Omicron variants BA.4 and BA.5 dominated the fifth COVID-19 epidemiological wave in Mexico. Authorea, Preprint.

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135 - Castelan-Sanchez,H.G., Delaye,L., Inward,R.P.D., Dellicour,S., Gutierrez,B., Martinez de la Vina,N., Pybus,O.G., de Anda Jauregui,G., Guzman,P., Flores-Garrido,M., Fontanelli,O., Hernandez-Rosales,M., Meneses,A., Olmedo-Alvarez,G., Herrera-Estrella,A., Boukadida,C., Sanchez-Flores,A., Munoz-Medina,J.E., Comas-Garcia,A., Gomez-Gil,B., Zarate,S., Taboada,B., Lopez,S., Arias,C.F., Kraemer,M.U.G., Lazcano,A., Escalera-Zamudio,M. (2022). Comparing the evolutionary dynamics of predominant SARS-CoV-2 virus lineages co-circulating in Mexico_. bioRxiv, Preprint posted August 10.

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136 - Garcia-Lopez,R., Rivera-Gutierrez,X., Rosales-Rivera,M., Taboada,B., Zarate,S., Munoz-Medina,J.E., Roche,B., Herrera-Estrella,A., Gomez-Gil,B., Sanchez-Flores,A., Arias,C.F. (2022). SARS-CoV-2 BW.1, a fast-growing Omicron variant from southeast Mexico bearing relevant escape mutations. Research Square, Preprint 21 Nov.

Preprint

137 - Lonardi,S., Singh,P., Liang,Q., Vydyam,P., Khabirova,E., Fang,T., Gihaz,S., Thekkiniath,J., Munshi,M., Abel,S., Batugedara,G., Gupta,M., Lu,X.M., Lenz,T., Chakravarty,S., Cornillot,E., Hu,Y., Ma,W., Gonzalez,L.M., Sanchez,S., Sanchez-Flores,A., Estrada,K., Harb,O.S., Le Roch,K.G., Ben Mamoun,C. (2022). Decoding The Nuclear Genome of The Human Pathogen Babesia duncani Shed Light on its Virulence, Drug Susceptibility and Evolution among Apicomplexa. bioRxiv, Preprint posted May 09.

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preprint

140 - Rodriguez-Maldonado,A.P., Vazquez-Perez,J.A., Cedro-Tanda,A., Taboada,B., Boukadida,C., Wong-Arambula,C., Nunez-Garcia,T.E., Cruz-Ortiz,N., Barrera-Badillo,G., Hernandez-Rivas L., Lopez-Martinez,I., Mendoza-Vargas,A., Reyes-Grajeda,J.P., Alcaraz,N., Penaloza-Figueroa,F., Gonzalez-Barrera,D., Rangel-DeLeon,D., Herrera-Montalvo,L.A., Mejia-Nepomuceno,F., Hernandez-Teran,A., Mujica-Sanchez,M., Becerril-Vargas,E., Martinez-Orozco,J.A., Perez-Padilla,R., Salas-Hernandez,J., Sanchez-Flores,A., Isa,P., Matias-Florentino,M., Avila-Rios,S., Munoz-Medina,J.E., Grajales-Muniz,C., Salas-Lais,A.G., Santos Coy-Arechavaleta,A., Hidalgo-Miranda,A., Arias,C.F., Ramirez-Gonzalez,J.E. (2021). Emergence and spread of the potential variant of interest (VOI) B.1.1.519 of SARS-CoV-2 predominantly present in Mexico. Medarxiv, Preprint posted Posted May 20.

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142 - Sanchez-Flores,F.A. (2021). Carta editorial de "La Ciencia, de Morelos para el Mundo": Catorce años ininterrumpidos de divulgación de la ciencia. La Unión de Morelos, 17 de mayo.

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143 - Sanchez-Flores,F.A. (2021). COVID-19: La ciencia y su impacto en las pol¡ticas de salud pública durante la pandemia. La Unión de Morelos, 12 de abril.

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144 - Sanchez-Flores,F.A. (2021). Sobre los hombros de gigantes: Los alcances y aplicaciones de la Ciencia. La Unión de Morelos, 15 de febrero.

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148 - Sanchez-Flores,F.A. (2020). La carrera hacia la vacuna contra COVID-19 (Primera Parte). La Unión de Morelos, 07 de septiembre.

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149 - Sanchez-Flores,F.A. (2020). La carrera hacia la vacuna contra COVID-19 (Segunda Parte). La Unión de Morelos, 14 de septiembre.

Nacional divulgación

150 - Sanchez-Flores,F.A. (2020). COVID19: A casi un año del inicio de la pandemia (Tercera parte). La Unión de Morelos, 07 de diciembre.

Nacional divulgación

151 - Sanchez-Flores,F.A. (2020). Premio Nobel de Química 2020: Herramientas para la edición genómica. La Unión de Morelos, 19 de octubre.

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152 - Sanchez-Flores,F.A. (2020). La situación actual del COVID-19 en México y en el mundo. La Unión de Morelos, 09 de marzo.

Nacional divulgación

153 - Sanchez-Flores,F.A. (2020). CÓMO LA CIENCIA ABIERTA PUEDE AYUDAR AL MUNDO EN UNA EPIDEMIA. La Unión de Morelos, 03 de febrero.

Nacional divulgación

154 - Sanchez-Flores,F.A. (2020). COVID-19: A seis meses del inicio de la pandemia (Primera parte). La Unión de Morelos, 15 de junio.

Nacional divulgación

155 - Sanchez-Flores,F.A. (2020). La ciencia y las mujeres: el Premio ACMor a la Profesora Distinguida y el Dia Internacional de la Mujer y la Niña en la Ciencia. La Unión de Morelos, 17 de febrero.

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156 - Sanchez-Flores,F.A. (2020). Los logros más importantes en ciencia y tecnología en el 2020. La Unión de Morelos, 28 de diciembre.

Nacional divulgación

157 - Sanchez-Flores,F.A. (2020). COVID19: A casi un año del inicio de la pandemia (Primera parte). La Unión de Morelos, 23 de noviembre.

Nacional divulgación

158 - Sanchez-Flores,F.A. (2020). COVID19: A casi un año del inicio de la pandemia (Segunda parte). La Unión de Morelos, 30 de noviembre.

Preprint

159 - Sanchez-Reyes,A., Breton-Deval,L.M., Mangelson,H., Salinas-Peralta,I., Sanchez-Flores,A. (2020). Hi-C deconvolution of a textile-dye degrader microbiome reveals novel taxonomic landscapes and link phenotypic potential to individual genomes. bioRxiv, Preprint posted June 18, 2020.

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160 - Taboada,B., Vazquez-Perez,J.A., Munoz-Medina,J.E., Ramos-Cervantes,P., Escalera-Zamudio,M., Boukadida,C., Sanchez-Flores,A., Isa,P., Mendieta-Condado,E., Martinez-Orozco,J.A., Becerril-Vargas,E., Salas-Hernandez,J., Grande,R., Gonzalez-Torres,C., Gaytan-Cervantes,F.J., Vazquez,G., Pulido,F., Araiza-Rodriguez,A., Garces-Ayala,F., Gonzalez-Bonilla,C.R., Grajales-Muniz,C., Borja-Aburto,V.H, Barrera-Badillo,G, Lopez,S., Hernandez-Rivas,L, Perez-Padilla,R, Lopez Martinez,I, Avila-Rios,S, Ruiz-Palacios,G, Ramirez-Gonzalez,J.E, Arias,C.F. (2020). Genomic analysis of early SARS-CoV-2 strains introduced in Mexico. bioRxiv, Preprint posted May 30, 120402.

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164 - Breton-Deval,L., Juarez,K., Sanchez-Flores,A., Vera-Estrella,R. (2019). Water quality assessments and metagenomic analysis of the polluted river Apatlaco, Mexico. bioRxiv, Preprint 21 January 2019, 536128.

Nacional divulgación

165 - Sanchez-Flores,F.A. (2019). Logros y potencial de la Biotecnología en México. La Unión de Morelos, 07 de octubre.

Nacional divulgación

166 - Sanchez-Flores,F.A. (2019). La ciencia y la belleza. ¿Ser atractivos nos da ventajas?. La Unión de Morelos, 09 de diciembre.

Nacional divulgación

167 - Sanchez-Flores,F.A. (2019). Animales fabulosos: Estrategias de supervivencia en la naturaleza. La Unión de Morelos, 16 de septiembre.

Nacional divulgación

168 - Sanchez-Flores,F.A. (2019). Los logros más importantes en ciencia y tecnología del 2019. La Unión de Morelos, 30 de diciembre.

Nacional divulgación

169 - Sanchez-Flores,F.A. (2019). La necesidad de contrapesos en la Ciencia en México y sus políticas. La Unión de Morelos, 16 de diciembre.

Nacional divulgación

170 - Sanchez-Flores,F.A. (2019). El huevo o la gallina: ¿Aplicación de la ciencia o ciencia aplicada? (Primera Parte). La Unión de Morelos, 08 de julio.

Nacional divulgación

171 - Sanchez-Flores,F.A. (2019). El huevo o la gallina: ¿Aplicación de la ciencia o ciencia aplicada? (Tercera Parte). La Unión de Morelos, 22 de julio.

Nacional divulgación

172 - Sanchez-Flores,F.A. (2019). El huevo o la gallina: ¿Aplicación de la ciencia o ciencia aplicada? (Segunda Parte). La Unión de Morelos, 15 de julio.

Divulgación

173 - Jimenez-Jacinto, V., Escobar-Zepeda, A., Godoy, E., Vega-Alvarado, L., Verleyen, J., Estrada, K., Sanchez-Flores, A. (2017). El metagenoma del taco. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 8, 29-32.

Divulgación

174 - Sanchez-Flores,A. (2015). Las nuevas tecnologías y el cómputo nos ayudan a estudiar detalladamente a los patógenos. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 2, 3-4.

Divulgación

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News Item

176 - Sanchez-Flores,A. (2012). Sequencing parasite populations. Nature Reviews Microbiology, 10 (2), 85. *

News Item

177 - Sanchez-Flores,A. (2011). A new piece of the eukaryotic puzzle. Nature Reviews Microbiology, 9 (11), 769. *

News Item

178 - Sanchez-Flores,A. (2011). A 'clap' for in silico studies. Nature Reviews Microbiology, 9 (1), 7. *

Ver publicaciones anteriores

Tesis

179 - Sanchez Flores, Fidel Alejandro (2007). Analisis de perfiles de entropia en familias estructurales de proteinas . Instituto de Biotecnologia, Doctor en Ciencias Bioquimicas, UNAM.

Asesor: Segovia Forcella, Lorenzo Patrick

180 - Sanchez Flores, Fidel Alejandro (2001). Expresion recombinante de la cloro de la cloroperoxidasa de Caldariomy fumago. Instituto de Investigaciones Biomedicas, Licenciatura en Investigacion Biomedica Basica, UNAM. *

Asesor: Valderrama Blanco, Brenda

2026

Artículo

181 - Taboada,B., Zarate,S., Munoz-Medina,J.E., Sanchez-Flores,A., Herrera-Estrella,A., Gomez-Gil,B., Vazquez-Perez,J.A., Salas-Lais,A.G., Zarate,A., Arias,C.F.. Genomic Diversity and Geographic Distribution of SARS-CoV-2 in Mexico: Insights From 4 Years of Genomic Surveillance. Archives of Medical Research, 57 (2), 103289.

2025

Artículo

182 - Calderon-Ezquerro,M.C., Brunner-Mendoza,C., Guerrero-Guerra,C., Sanchez-Flores,A., Salinas-Peralta,I., Toriello,C., Ponce de Leon,A., Ortega-Rosas,C.I.. Genetic sequencing of the airborne fungal spectrum and air quality at a public hospital in Mexico City. PLOS Global Public Health, 5 (6), e0004784.

Artículo

183 - Lopez-Teros,M., Avila-Galicia,K.E., Librado-Osorio,R., Jimenez-Jacinto,V., Garcia-Alvarez,J.A., Hernandez-Montes,G., Sanchez-Flores,A., Alarcon-Aguilar,A., Luna-Lopez,A., Konigsberg,M.. Palmitate-Induced Primary Rat Senescent Astrocytes Exhibit Higher Inflammatory Activity and a Distinct Transcriptomic Profile Compared to Reactive Astrocytes. Journal of Neurochemistry, 169 (7), e70164.

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184 - Martinez-Garcia,G., Estrada,K., Lira-Amaya,J.J., Santamaria-Epinosa,R.M., Lopez-Arellano,M.E., Sciutto-Conde,E.L., Rojas-Martinez,C., Alvarez-Martinez,J.A., Sanchez-Flores,A., Figueroa-Millan,J.V. Comparative Analysis of Immune Response Genes Induced by a Virulent or Attenuated Strain of Babesia bigemina. International Journal of Molecular Sciences, 26 (2), 487.

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Artículo

186 - Zarate,S., Taboada,B., Torres-Rivera,K., Bautista-Carbajal,P., Garcia-Leon,M.L., Tabla-Orozco,V., Juarez-Tobias,M.S., Noyola,D.E., Martinez-Arce,P.A., Espinosa-Sotero,M.D., Martinez-Aguilar,G., Rojas-Larios,F., Sanchez-Flores,A., Arias,C.F., Wong-Chew,R.M.. Circulation of RSV Subtypes A and B Among Mexican Children During the 2021-2022 and 2022-2023 Seasons. Pathogens, 14 (10), 996.

Preprint

187 - Ozubek,S., Sanchez-Flores,A., Montero,E., Alzan,H., Suarez,C., Grande,R., Gil-Iglesias,A., Bastos,R., Aktas,M., Gonzalez,L.M.. Comparative analysis of the EF-1Iñ Intergenic Region in Babesia divergens isolates: Insights into TA Repeat Variation and Potential Regulatory Implications. bioRxiv, Preprint posted August 11.

Nacional divulgación

188 - Sanchez-Flores,A.. Los logros científicos y tecnológicos más importantes del 2024. La Unión de Morelos, 6 enero.

nacional divulgación

189 - Sanchez-Flores,F.A.. La marca del Bienestar: revisitando las políticas del siglo XX. Union de Morelos, 12 de junio.

Nacional divulgación

190 - Sanchez-Flores,F.A.. Las políticas para el impulso del ecosistema 'Pharma' en México: ¿Cuáles pueden ser los resultados esperados?. La Unión de Morelos, 11 de junio.

Nacional divulgación

191 - Sanchez-Flores,F.A.. Elección del Poder Judicial 2025: la ciudadanía entre la espada y la pared. Union de Morelos, 2 de abril.

Nacional divulgacion

192 - Sanchez-Flores,F.A.. ¡Querida, encogí el genoma! ¿Cómo evoluciona la vida sintética?. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 11 (42).

Protocolo

193 - Zurita-Artaloitia,J.M., Salinas-Peralta,I.P., Escobar-Zepeda,A., Verleyen,J., Sanchez,A., Pardo-Lopez,L.. Bioinformatic workflow for Nanopore metabarcoding analysis. Protocols.io.

2024

Artículo

194 - Brunner-Mendoza,C., Calderon-Ezquerro,M.C., Guerrero-Guerra,C., Sanchez-Flores,A., Salinas-Peralta,I., Toriello,C.. Diversity and Composition of the Airborne Fungal Community in Mexico City with a Metagenomic Approach. Microorganisms, 12 (12), 2632.

Artículo

195 - Calderon-Ezquerro,M.C., Ponce de Leon,A.A., Brunner-Mendoza,C., Guerrero-Guerra,C.C., Sanchez-Flores,A., Salinas-Peralta,I., Lopez-Jacome,L.E., Colin-Castro,C.A, Martinez-Zavaleta,M.G.. Assessment of airborne bacteria from a public health institution in Mexico City. PLOS Global Public Health, 4 (11), e0003672.

Artículo

196 - Embarcadero-Jimenez,S., Araujo-Palomares,C.L., Moreno-Perlin,T., Ramirez-Alvarez,N., Quezada-Hernandez,C., Batista-Garcia,R.A., Sanchez-Flores,A., Calcaneo-Hernandez,G., Silva-Jimenez,H.. Physiology and comparative genomics of the haloalkalitolerant and hydrocarbonoclastic marine strain Rhodococcus ruber MSA14. Archives of Microbiology, 206 (7), 328.

Artículo

197 - Garcia-Lopez,R., Taboada,B., Zarate,S., Munoz-Medina,J.E., Salas-Lais,A.G., Herrera-Estrella,A., Boukadida,C., Vazquez-Perez,J.A., Gomez-Gil,B., Sanchez-Flores,A., Arias,C.F.. Exploration of low-frequency allelic variants of SARS-CoV-2 genomes reveals coinfections in Mexico occurred during periods of VOCs turnover. Microbial Genomics, 10 (3), 001220.

Artículo

198 - Millan-Lopez,S., Zurita-Artaloitia,J.M., Silva-Jimenez,H., Pardo-Lopez,L., Sanchez-Flores,A.. Genomic sequence of three hydrocarbonoclastic pseudomonadaceae strains isolated from marine sediments of the port of Rosarito, Baja California, Mexico. Microbiology Resource Announcements, 13 (7), e0033524.

Artículo

199 - Rojas-Vargas,J., Rebollar,E.A., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L.. A comparative genomic study of a hydrocarbon-degrading marine bacterial consortium. PLoS ONE, 19 (8), e0303363.

Artículo

200 - Santamaria,R.M., Estrada,K., Lopez,M.E., Rojas,E., Martinez,G., Alcala,Y., Rojas,C., Alvarez,J.A., Lira,J.J., Santamaria,T.V., Sanchez-Flores,A., Figueroa,J.V.. Comparative Transcriptome Analysis of Babesia bigemina Attenuated Vaccine and Virulent Strains of Mexican Origin. Vaccines (Basel), 12 (3), 309.

Artículo

201 - Singh,P., Vydyam,P., Fang,T., Estrada,K., Gonzalez,L.M., Grande,R., Kumar,M., Chakravarty,S., Berry,V., Ranwez,V., Carcy,B., Depoix,D., Sanchez,S., Cornillot,E., Abel,S., Ciampossin,L., Lenz,T., Harb,O., Sanchez-Flores,A., Montero,E., Le Roch,K.G., Lonardi,S., Mamoun,C.B.. Insights Into the Evolution, Virulence and Speciation of Babesia MO1 and Babesia divergens Through Multiomics Analyses. Emerging Microbes and Infections, 13 (1), 2386136.

Nacional divulgacion

202 - Sanchez-Flores,A.. Los logros científicos y tecnológicos más importantes del 2023 (primera parte). La Unión de Morelos, 02 de enero.

Nacional divulgacion

203 - Sanchez-Flores,A.. Los logros científicos y tecnológicos más importantes del 2023 (segunda parte). La Unión de Morelos, 08 de enero.

Preprint

204 - Singh,P., Vydyam,P., Fang,T., Kumar,M., Estrada,K., Grande,R., Sanchez-Flores,A., Gonzalez,L.M., Montero,E., Chakravarty,S., Lonardi,S., Berry,V,, Ranwez,V., Carcy,B., Depoix,D., Sanchez,S., Cornillot,E., Abel,S., Ciampossin,L., Lenz,T., Le Roch,K.G., Harb,O.S., Ben Mamoun,C.. Multiomics analysis reveals B. MO1 as a distinct Babesia species and provides insights into its evolution and virulence. bioRxiv, Preprint posted January 18.

2023

Artículo

205 - Castelan-Sanchez,H.G., Delaye,L., Inward,R.P.D., Dellicour,S., Gutierrez,B., Martinez de la Vina,N., Boukadida,C., Pybus,O.G., de Anda Jauregui,G., Guzman,P., Flores-Garrido,M., Fontanelli,O., Hernandez-Rosales,M., Meneses,A., Olmedo-Alvarez,G., Herrera-Estrella,A., Sanchez-Flores,A., Munoz-Medina,J.E., Comas-Garcia,A., Gomez-Gil,B., Zarate,S., Taboada,B., Lopez,S., Arias,C.F., Kraemer,M.U.G., Lazcano,A., Escalera-Zamudio,M.. Comparing the evolutionary dynamics of predominant SARS-CoV-2 virus lineages co-circulating in Mexico. Elife, 12, e82069.

Artículo

206 - Garcia-Lopez,R., Rivera-Gutierrez,X., Rosales-Rivera,M., Zarate,S., Munoz-Medina,J.E., Roche,B., Herrera-Estrella,A., Gomez-Gil,B., Sanchez-Flores,A., Taboada,B., Arias,C.F.. SARS-CoV-2 BW lineage, a fast-growing Omicron variant from southeast Mexico bearing relevant escape mutations. Infection, 51, 1549-1555.

Artículo

207 - Geiger,O., Sanchez-Flores,A., Padilla-Gomez,J., Degli-Esposti M.. Multiple approaches of cellular metabolism define the bacterial ancestry of mitochondria. Science Advances, 9 (32), eadh0066.

Artículo

208 - Loza,A., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., Zarate,S., Lopez,S., Ciria,R., Palomares,D., Garcia-Lopez,R., Isa,P., Taboada,B., Rosales,M., Boukadida,C., Herrera-Estrella,A., Mojica,N.S., Rivera-Gutierrez,X., Munoz-Medina,J.E., Salas-Lais,A.G., Sanchez-Flores,A., Vazquez-Perez,J.A., Arias,C.F., Gutierrez-Rios,R.M.. Two-year follow-up of the COVID-19 pandemic in Mexico. Frontiers in Public Health, 10, 1050673.

Articulo

209 - Murga-Garrido,S.M., Ulloa-Perez,E.J., Diaz-Benitez,C.E, Orbe-Orihuela,Y.C, Cornejo-Granados,F., Ochoa-Leyva,A, Sanchez-Flores,A, Cruz,M, Castaneda-Marquez,A.C, Plett-Torres,T, Burguete-Garcia,A.I., Lagunas-Martinez,A.. Virulence Factors of the Gut Microbiome Are Associated with BMI and Metabolic Blood Parameters in Children with Obesity. Microbiology Spectrum, 11 (2), e0338222.

Artículo

210 - Nabor-Romero,O., Zavaleta-Mejia,E., Ochoa-Martinez,D.L., Silva-Valenzuela,M., Vega-Arreguin,J., Sanchez-Flores,A., Rojas-Martinez,R.I. Transcriptional alterations induced by Nacobbus aberrans in interaction with chili pepper CM-334 and Phytophthora capsici. Physiological and Molecular Plant Pathology, 123, 101942.

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211 - Rojas-Vargas,J., Adaya,L., Lacerda,A.L., Pedrotti,M.-L., Sanchez-Flores,A., Pardo-Lopez,L.. Draft genome sequences of six bacteria isolated from polylactic acid samples from the Mediterranean Sea. Microbiology Resource Announcements, 12 (11), e0079423.

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212 - Singh,P., Lonardi,S., Liang,Q., Vydyam,P., Khabirova,E., Fang,T., Gihaz,S., Thekkiniath,J., Munshi,M., Abel,S., Ciampossin,L., Batugedara,G., Gupta,M., Lu,X.M., Lenz,T., Chakravarty,S., Cornillot,E., Hu,Y., Ma,W., Gonzalez,L.M., Sanchez,S., Estrada,K., Sanchez-Flores,A., Montero,E., Harb,O.S., Le Roch,K.G., Mamoun,C.B.. Babesia duncani multi-omics identifies virulence factors and drug targets. Nature Microbiology, 8 (5), 845-859.

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Dr. Fidel Alejandro Sanchez Flores Investigador Titular B Tiempo Completo Departamento de Microbiología Molecular

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