Epidemiología, diagnóstico y metagenómica viral
Genómica funcional de la interacción virus-célula hospedera
Biología molecular y celular de la infección por virus gastrointestinales
Número de registros: 20
  • Activos
  • Vencidos
  • Identification of factors that affect the cell entry of the virus sars-cov-2, Pew Charitable Trusts, 2022 - 2023
  • Pronaii 3 infecciones virales del tracto gastrointestinal, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2020 - 2025
  • Caracterización de las estrategias activadas por los rotavirus para evadir la respuesta antiviral del hospedero, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2019 - 2022
  • caracterización molecular de interacciones rotavirus-célula huésped que favorecen la replicación viral., DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2017 - 2020
  • Diagnóstico de sars cov2 ibt campus morelos /lesp morelos, capacitación de laboratorios de la academia y optimizaciones metodológicas, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2020 - 2021
  • Implementación de un ensayo serológico para diagnosticar infecciones por los flavivirus más frecuentes: zika, dengue, virus del oeste del nilo y fiebre amarilla, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2018 - 2021
  • Red mexicana de virología, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2018 - 2019
  • Diagnóstico diferencial de zika y dengue y covid-19, 2017 - 2021
  • Red mexicana de virología, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2017 - 2018
  • Estudio de las interacciones virus-célula huésped utilizando diferentes modelos virales, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2015 - 2016
  • Interacción virus-célula huésped. biología molecular de virus y genómica funcional, PRESUPUESTO UNAM, 2014 - 2020
  • Caracterización de las interacciones de los rotavirus con su célula huésped necesarias para el establecimiento de una infección productiva, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2012 - 2016
  • Mecanismos de evasión de la respuesta antiviral por rotavirus, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2011 - 2013
  • Caracterización de la diversidad genética de virus de influenza circulantes en humanos, cerdos y aves, FONDO SECTORIAL DE INVESTIGACIÓN EN SALUD Y SEGURIDAD SOCIAL, 2010 - 2012
  • Identificación de los factores traduccionaless que participan en la síntesis de proteínas de rotavirus, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 2008 - 2010
  • Caracterización de las interacciones rotavirus-célula huésped necesarias para el establecimiento de una infección productiva, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2007 - 2010
  • Rotavirus-host cell interactions during the viral replication cycle, HOWARD HUGHES MEDICAL INSTITUTE, 2005 - 2011
  • Grant of the international research scholars program. infectious diseases and parasitology, 2000., HOWARD HUGHES MEDICAL INSTITUTE, 2000 - 2005
  • Vacunas recombinantes contra rotavirus: desarrollo y evaluación, CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA, 2000 - 2002
  • Caracterización de las interacciones tempranas de los rotavirus con su célula huésped, DIRECCIÓN GENERAL DE ASUNTOS DEL PERSONAL ACADÉMICO/UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, 1999 - 2002

Nivel D del PRIDE
Nivel III del SNI
  • Doctorado, en Investigacion Biomedica Basica, UACPyP-CCH-UNAM (1986)

  • Maestría, en Investigacion Biomedica Basica, UACPyP-CCH-UNAM (1983)

  • Licenciatura, Investigacion Biomedica Basica, UACPyP-CCH-UNAM (1980)

  • Premio Universidad Nacional en el área de Investigación en Ciencias Naturales, UNAM, 2013

  • For woman in Science, Loreal-UNESCO Francia, 2012

  • Medalla Omecihuatl Inmujeres, Instituto de las Mujeres de la Ciudad de México o, 2012

  • Howard Hughes Medical Institute International Research Scholar 2005-2010, 2005

  • Premio Bienal Funsalud en Enfermedades Gastrointestinales (NADRO), Fundación Mexicana para la Salud, 2002

  • Premio Carlos J. Finlay de Microbiología, UNESCO, 2001

  • Premio Bienal FUNSALUD en Infecciones Gastrointestinales, Fundación Mexicana para la Salud, 2000

  • Howard Hughes Medical Institute International Research Scholar 2000-2005, 2000

  • Premio de la Academia de la Investigación Científica en el área de Ciencias Naturales, 1993

  • Doctorado
  • Licenciatura
  • Maestría.
3 - Oceguera Cabrera, Alfonso (2019). El RNA de rotavirus secuestra a varias proteinas de union al RNA celulares . Instituto de Biotecnologia, Doctorado en Bioquimicas, UNAM.
4 - Candido Lopez, Anaid Alethia (2018). Efecto de la metilacion (n6metiladenosina) del RNA en el ciclo replicativo de rotavirus. Facultad de Quimica, Licenciado en Quimica Farmaceutico Biologica, UNAM. *
7 - Valencia Camargo, Alma Delia (2016). Rotavirus media la degradacion de ifitm 2/3 inducida por ifn tipo i. Instituto de Biotecnologia, Maestria en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
8 - Marin Tovar, Yerli (2015). Caracterizacion del proceso de traduccion durante la infeccion por rotavirus . Instituto de Biotecnologia, Maestria en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
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15 - Oceguera Cabrera, Alfonso (2012). Caracterizacion del inicio de la transcripcion y desnudamiento de rotavirus . Instituto de Biotecnologia, Maestria en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
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19 - Escobar Zarate, Diana Luz (2009). Caracterizacion de las proteinas componentes de los SGS durante la infeccion con rotavirus . Instituto de Biotecnologia, Maestria en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
20 - Ayala Breton, Camilo (2009). Elementos que definen y regulan la funcion del RNA mensajero de rotavirus . Instituto de Biotecnologia, Doctorado en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
22 - Montero L. de Guevara, Hilda (2007). Regulacion de la sintesis de proteina celular y viral durante una infeccion por rotavirus. Instituto de Biotecnologia, Doctorado en Ciencias Biologicas, UNAM.
23 - Gutierrez Mayret, Michelle (2007). Caracterizacion de la via de entrada de la cepa humana de rotavirus WA . Instituto de Biotecnologia, Maestria en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
24 - Zayas Lopez, Margarita Laura (2006). Caracterizacion del proceso de morfogenesis de rotavirus . Instituto de Biotecnologia, Maestria en Ciencias Bioquimicas, UNAM.
30 - Cuadras Ramirez, Mariela Aide (1998). Estudio sobre el mecanismo de penetracion de los rotavirus a su celula huesped . Instituto de Biotecnologia, Doctorado en Ciencias (Bioquimica), UNAM.
31 - Almanza Sanchez, Leticia (1994). Secuenciacion del gene 1 de rotavirus porcino YM. Instituto de Biotecnologia, Maestria en Investigacion Biomedica Basica, UNAM.
32 - Mendez Salinas, Ernesto (1993). Estudios sobre la adsorcion y penetracion de los rotavirus a su celula huesped. Instituto de Biotecnologia, Doctorado en Biotecnologia, UNAM.
33 - Mendez Salinas, Ernesto (1990). Rearreglos genomicos de rotavirus. Instituto de Biotecnologia, Maestria en Investigacion Biomedica Basica, UNAM.
Total de publicaciones: 200
  • Tipo
  • Fecha
Open Access Note, News, Feature
34 - Alcantara,L.C.J., Amenga-Etego,L., Andersson,R., Bhaumik,M., Choi,Y.K., Decaluwe,H., Geoghegan,J., Haagmans,B.L., Lopez,S., Mukhtar,M.M., Nelwan,E., Rahal,E.A., Sato,K., Sklan,E.H., Fang,Y.S.C. (2022). Methods for fighting emerging pathogens. Nature Methods, 19 (4), 395-397.
Open Access Artículo
35 - Boukadida,C., Taboada,B., Escalera-Zamudio,M., Isa,P., Ramirez-Gonzalez,J.E., Vazquez-Perez,J.A., Munoz-Medina,J.E., Grajales-Muniz,C., Gonzalez-Torres,C., Gaytan-Cervantes,F.J., Rincon-Rubio,A., Matias-Florentino,M., Paz-Juarez,H.E., Sanchez-Flores,A., Mendieta-Condado,E., Barrera-Badillo,G., Hernandez-Rivas,L., Lopez,S., Lopez-Martinez,I, Avila-Rios,S., Arias,C.F. (2022). Genomic Characterization of SARS-CoV-2 Isolated from Patients with Distinct Disease Outcomes in Mexico. Microbiology Spectrum, 10 (1), e01249-21.
Open Access Artículo
37 - Moreno-Contreras,J., Espinoza,M.A., Sandoval-Jaime,C., Cantu-Cuevas,M.A., Madrid-Gonzalez,D.A., Baron-Olivares,H., Ortiz-Orozco,O.D., Munoz-Rangel,A.V., Guzman-Rodriguez,C., Hernandez-de la Cruz M., Eroza-Osorio,C.M., Arias,C.F., Lopez,S. (2022). Pooling saliva samples as an excellent option to increase the surveillance for SARS-CoV-2 when re-opening community settings. PLoS ONE, 17 (1), e0263114.
Artículo
Artículo
39 - Rivera-Gutierrez,X., Moran,P., Taboada,B., Serrano-Vazquez,A., Isa,P., Rojas-Velazquez,L., Perez-Juarez,H., Lopez,S., Torres,J., Ximenez,C., Arias,C.F. (2022). High Prevalence and Diversity of Caliciviruses in a Community Setting Determined by a Metagenomic Approach. Microbiology Spectrum, 10 (1), e0185321.
Open Access Artículo
40 - Taboada,B., Zarate,S., Garcia-Lopez,R., Munoz-Medina,J.E., Sanchez-Flores,A., Herrera-Estrella,A., Boukadida,C., Gomez-Gil,B., Selem-Mojica N., Rosales-Rivera,M., Salas-Lais,A.G., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Rivera-Gutierrez,X., Vazquez-Perez,J.A., Avila-Rios,S., Hurtado,J.M., Herrera-Najera,C.I., Nunez-Contreras,J.J., Sarquiz-Martinez,B, Garcia-Arias,V.E., Santiago-Mauricio,M.G., Martinez-Miguel,B., Enciso-Ibarra,J., Chaidez-Quiroz,C., Isa,P., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., Lopez,S., Arias,C.F. (2022). Dominance of Three Sublineages of the SARS-CoV-2 Delta Variant in Mexico. Viruses, 14 (6), 1165.
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41 - Zarate,S., Taboada,B., Munoz-Medina,J.E., Isa,P., Sanchez-Flores,A., Boukadida,C., Herrera-Estrella,A., Selem-Mojica N., Rosales-Rivera,M., Gomez-Gil,B., Salas-Lais,A.G., Santacruz-Tinoco,C.E., Montoya-Fuentes,H., ALvarado-Yaah,J.E., Molina-Salinas,G.M., Espinoza-Ayala,G.E., Enciso-Moreno,J.A., Gutierrez-Rios,R.M., Loza,A., Moreno-Contreras,J., Garcia-Lopez,R., Rivera-Gutierrez,X., Comas-Garcia,A., Wong-Chew,R.M., Jimenez-Corona,M.E., del Angel,R.M., Vazquez-Perez,J.A., Matias-Florentino,M., Perez-Garcia,M., Avila-Rios,S., Castelan-Sanchez,H.G., Delaye,L., Martinez-Castilla,L.P., Escalera-Zamudio,M., Lopez,S., Arias,C.F. (2022). The Alpha Variant (B.1.1.7) of SARS-CoV-2 Failed to Become Dominant in Mexico. Microbiology Spectrum, 10 (2), e0224021.
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44 - Taboada,B., Moran,P., Serrano-Vazquez,A., Isa,P., Rojas-Velazquez,L., Perez-Juarez,H., Lopez,S., Torres,J., Ximenez,C., Arias,C.F. (2021). The gut virome of healthy children during the first year of life is diverse and dynamic. PLoS ONE, 16 (4), e0240958.
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45 - Taboada-Ramirez,B., Zarate,S., Isa,P., Boukadida,C., Vazquez-Perez,J.A., Munoz-Medina,J.E., Ramirez-Gonzalez,J.E., Comas-Garcia,A., Grajales-Muniz,C., Rincon-Rubio,A., Matias-Florentino,M., Sanchez-Flores,A., Mendieta-Condado,E., Verleyen,J., Barrera-Badillo,G., Hernandez-Rivas,L., Mejia-Nepomuceno,F., Martinez-Orozco,J.A., Becerril-Vargas,E., Lopez,S., Lopez-Martinez,I., Avila-Rios,S., Arias,C.F. (2021). Genetic Analysis of SARS-CoV-2 Variants in Mexico during the First Year of the COVID-19 Pandemic. Viruses, 13 (11), 2161.
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46 - Aguado-Garcia,Y., Taboada,B., Moran,P., Rivera-Gutierrez,X., Serrano-Vazquez,A., Isa,P., Rojas-Velazquez,L., Perez-Juarez,H., Lopez,S., Torres,J., Ximenez,C., Arias,C.F. (2020). Tobamoviruses can be frequently present in the oropharynx and gut of infants during their first year of life. Scientific Reports, 10 (1), 13595.
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47 - Deng,X.D., Achari,A., Federman,S., Yu,G., Somasekar,S., Bartolo,I., Yagi,S., Mbala-Kingebeni,P., Kapetshi,J., Ahuka-Mundeke,S., Muyembe-Tamfum,J.J., Ahmed,A.A., Ganesh,V., Tamhankar,M., Patterson,J.L., Ndembi,N., Mbanya,D., Kaptue,L., McArthur,C., Munoz-Medina,J.E., Gonzalez-Bonilla,C.R., Lopez,S., Arias,C.F., Arevalo,S., Miller,S., Stone,M., Busch,M., Hsieh,K., Messenger,S., Wadford,D.A., Rodgers,M., Cloherty,G., Faria,N.R., Theze,J., Pybus,O.G., Neto,Z., Morais,J., Taveira,N., Hackett,R., Chiu,C.Y. (2020). Metagenomic sequencing with spiked primer enrichment for viral diagnostics and genomic surveillance. Nature Microbiology, 5, 443?454.
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50 - Moreno-Contreras,J., Espinoza,M.A., Sandoval-Jaime,C., Cantu-Cuevas,M.A., Baron-Olivares,H., Ortiz-Orozco,O.D., Munoz-Rangel,A.V., Hernandez-de la Cruz M., Eroza-Osorio,C.M., Arias,C.F., Lopez,S. (2020). Saliva sampling and its direct lysis, an excellent option to increase the number of SARS CoV2 diagnostic tests in settings with supply shortages. Journal of Clinical Microbiology, 58 (10), 01659-20.
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51 - Sanchez-Tacuba,L., Feng,N., Meade,N.J., Mellits,K.H., Jais,P.H., Yasukawa,L.L., Resch,T.K., Jiang,B., Lopez,S., Ding,S., Greenberg,H.B. (2020). An Optimized Reverse Genetics System Suitable for Efficient Recovery of Simian, Human, and Murine-Like Rotaviruses. Journal of Virology, 94 (18), e01294-20.
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52 - Taboada,B., Vazquez-Perez,J.A., Munoz-Medina,J.E., Ramos-Cervantes P., Escalera-Zamudio,M., Boukadida,C., Sanchez-Flores,A., Isa,P., Mendieta-Condado E., Martinez-Orozco,J.A., Becerril-Vargas,E., Salas-Hernandez,J., Grande,R., Gonzalez-Torres,C., Gaytan-Cervantes,F.J., Vazquez,G., Pulido,F., Araiza-Rodriguez A., Garces-Ayala F., Gonzalez-Bonilla,C.R., Grajales-Muniz C., Borja-Aburto,V, Barrera-Badillo G., Lopez,S., Hernandez-Rivas L., Perez-Padilla,R., Lopez-Martinez,I, Avila-Rios,S., Ruiz-Palacios,G., Ramirez-Gonzalez,J.E., Arias,C.F. (2020). Genomic Analysis of Early SARS-CoV-2 Variants Introduced in Mexico. Journal of Virology, 94 (18), e01056-20.
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55 - Martinez, J. L., Arnoldi, F., Schraner, E. M., Eichwald, C., Silva-Ayala, D., Lee, E., Sztul, E., Burrone, O. R., Lopez, S., Arias, C. F. (2019). The guanine nucleotide exchange factor GBF1 participates in rotavirus replication. Journal of Virology, 93 (19), 01062-19.
Open Access Artículo
61 - Elizondo-Quiroga, D., Medina-Sanchez, A., Sanchez-Gonzalez, J.M., Eckert, K.A., Villalobos-Sanchez, E., Navarro-Zuniga, A.R., Sanchez-Tejeda, G., Correa-Morales, F., Gonzalez-Acosta, C., Arias, C.F., Lopez, S., del Angel, R.M., Pando-Robles, V., Elizondo-Quiroga, A.E. (2018). Zika Virus in Salivary Glands of Five Different Species of Wild-Caught Mosquitoes from Mexico. Scientific Reports, 8 (1), 809.
Artículo; Actas Paper
62 - Lopez-Guerrero, D.V., Arias, N., Gutierrez-Xicotencatl, L., Chihu-Amparan, L., Gonzalez, A., Pedroza-Saavedra, A., Rosas-Salgado, G., Villegas-Garcia, J.C., Badillo-Godinez, O., Fernandez, G., Lopez, S., Esquivel-Guadarrama, F. (2018). Enhancement of VP6 immunogenicity and protective efficacy against rotavirus by VP2 in a genetic immunization. Vaccine, 36 (22), 3072-3078.
Artículo
Artículo
65 - Taboada,B., Isa,P., Gutierrez-Escolano,A.L., del Angel,R.M., Ludert,J.E., Vazquez,N., Tapia-Palacios,M.A., Chavez,P., Garrido,E., Espinosa,A.C., Eguiarte,L.E., Lopez,S., Souza,V., Arias,C.F. (2018). The Geographic Structure of Viruses in the Cuatro Cienegas Basin, a Unique Oasis in Northern Mexico, Reveals a Highly Diverse Population on a Small Geographic Scale. Applied and Environmental Microbiology, 84 (11), e00465-18.
Artículo
66 - Theze, J., Li, T., du Plessis, L., Bouquet, J., Kraemer, M.U.G., Somasekar, S., Yu, G., de Cesare, M., Balmaseda, A., Kuan, G., Harris, E., Wu, C.H., Ansari, M.A., Bowden, R., Faria, N.R., Yagi, S., Messenger, S., Brooks, T., Stone, M., Bloch, E.M., Busch, M., Munoz-Medina, J.E., Gonzalez-Bonilla, C.R., Wolinsky, S., Lopez, S., Arias, C.F., Bonsall, D., Chiu, C.Y., Pybus, O.G. (2018). Genomic Epidemiology Reconstructs the Introduction and Spread of Zika Virus in Central America and Mexico. Cell Host and Microbe, 23 (6), 855-864.
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Open Access Artículo
72 - Taboada,B.T., Isa,P., Espinoza,M.A., Aponte,F.E., Arias-Ortiz,M.A., Monge-Martinez,J., Rodriguez-Vazquez,R., Diaz-Hernandez,F., Zarate-Vidal,F., Wong-Chew,R.M., Firo-Reyes,V., Del Rio-Almendarez,C.N., Gaitan-Meza,J., Villasenor-Sierra,A., Martinez-Aguilar,G., Garcia-Borjas,M., Noyola,D.E., Perez-Gonzalez,L.F., Lopez,S., Santos-Preciado,J.I., Arias,C.F. (2016). Complete Genome Sequence of Human Coronavirus OC43 Isolated from Mexico. Genome Announcements, 4 (6).
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73 - Aponte,F.E., Taboada,B., Espinoza,M.A., Arias-Ortiz,M.A., Monge-Martinez,J., Rodriguez-Vazquez,R., Diaz-Hernandez,F., Zarate-Vidal,F., Wong-Chew,R.M., Firo-Reyes,V., Del Rio-Almendarez,C.N., Gaitan-Meza,J., Villasenor-Sierra,A., Martinez-Aguilar,G., Garcia-Borjas,M., Noyola,D.E., Perez-Gonzalez,L.F., Lopez,S., Santos-Preciado,J.I., Arias,C.F. (2015). Rhinovirus is an important pathogen in upper and lower respiratory tract infections in Mexican children. Virology Journal, 12, 31.
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79 - Wong-Chew,R.M., Espinoza,M.A., Taboada,B., Aponte,F.E., Arias-Ortiz,M.A., Monge-Martinez,J., Rodriguez-Vazquez,R., Diaz-Hernandez,F., Zarate-Vidal,F., Santos-Preciado,J.I., Lopez,S., Arias,C.F. (2015). Prevalence of respiratory virus in symptomatic children in private physician office settings in five communities of the state of Veracruz, Mexico. BMC Research Notes, 8 (1), 261.
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83 - Paulin,L.F., Soto-Del Rio,M.D, Sanchez,I., Hernandez,J., Gutierrez-Rios,R.M., Lopez-Martinez,I., Wong-Chew,R.M., Parissi-Crivelli,A., Isa,P., Lopez,S., Arias,C.F. (2014). PhyloFlu, a DNA microarray to determine the phylogenetic origin of influenza A gene segments and the genomic fingerprint of viral strains. Journal of Clinical Microbiology, 52 (3), 803-813.
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84 - Taboada,B., Espinoza,M.A., Isa,P., Aponte,F.E., Arias-Ortiz,M.A., Monge-Martinez,J., Rodriguez-Vazquez,R., Diaz-Hernandez,F., Zarate-Vidal,F., Wong-Chew,R.M., Firo-Reyes,V., Del Rio-Almendarez,C.N., Gaitan-Meza,J., Villasenor-Sierra,A., Martinez-Aguilar,G., Salas-Mier,M.D., Noyola,D.E., Perez-Gonzalez,L.F., Lopez,S., Santos-Preciado,J.I., Arias,C.F. (2014). Is There Still Room for Novel Viral Pathogens in Pediatric Respiratory Tract Infections?. PLoS ONE, 9 (11), e113570.
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