El grupo de la Dra. Liliana Pardo utiliza estrategias que emplean técnicas de microbiología y metagenómica que permiten el estudio de diferentes microorganismos y sus productos, así como sus capacidades asociadas a la degradación de hidrocarburos y plásticos y su potencial uso biotecnológico.

 

Para lo cual, realizamos cruceros oceanográficos en aguas profundas (hasta 3000 mts) del Golfo de MéxicoEl área de estudio a explorar abarca desde el norte del estado de Tamaulipas, hasta el sur del estado de Veracruz. A bordo del barco Justo Sierra de la UNAM, realizamos la toma de muestras de agua a diferentes profundidades, así como los sedimentos del fondo del mar. Una vez que las muestras llegan al laboratorio las utilizamos para distintos proyectos

 

  1. Atlas de las bacterias del Golfo de México. El grupo realiza estudios metagenómicos empleando las técnicas más actuales y de frontera que nos permiten obtener los ácidos nucleicos de diversos ambientes como agua y sedimento marino de aguas profundas y costas. Posteriormente por secuenciación masiva ya sea por medio de amplicones (16S ribosomal) o por shutgun (metagenomas completos), se obtienen mediante análisis bioinformáticos las especies bacterianas que habitan este ambiente. Los datos  son utilizados para constituir un Atlas bacteriano del Golfo de México.
  2. Consorcios bacterianos degradadores de hidrocarburos y plásticos. En esta línea de investigación nos damos a la tarea de cultivar y analizar el funcionamiento de consorcios marinos especializados en la degradación del petroleo y plásticos. Así mismo, diseñamos consorcios sintéticos bacterianos a partir de métodos factoriales predictivos utilizando diversas combinaciones de bacterias o a través de una aproximación poblacional, al considerar las interacciones entre las especies del consorcio y sus rutas metabólicas. Una vez que obtenemos los consorcios bacterianos especializados, realizamos ensayos de mesocosmos en agua de mar o en arenas costeras para comprobar su capacidad degradadora a una mayor escala.
  3. Bioprospección de enzimas marinasEl potencial biotecnológico de ambientes extremos como el marino es sin duda un campo de investigación que está en desarrollo y que ofrece una amplia variedad de posibilidades para la búsqueda de enzimas versátiles. Con el fin de obtener nuevos productos que estén involucrados en la degradación de hidrocarburos y plásticos así como en la formulación de detergentes, en esta línea de investigación nos damos a la tarea de buscar nuevas enzimas microbianas de tipo lipasas, esterasas, dioxigenasas y poliuretanasas, utilizando estrategias cultivo-dependientes y cultivo-independientes como la metagenómica.
Grupo de la Dra. Liliana Pardo Lopez

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