30May - 2022
Descubriendo circuitos genéticos en la emergencia de patrones celulares con secuenciación de célula única.
12:00 PM - 01:00 PM|Dr. Carlos Humberto Ortíz Ramírez|Investigador Principal, UGA-LANGEBIO/Cinvestav|Invitado por: Dr. Omar Homero Pantoja Ayala
Seminario
Resumen:
El establecimiento de patrones del desarrollo en órganos y tejidos es un aspecto fundamental del crecimiento en todos los seres vivos. Estos patrones determinan la diversidad morfológica y dan origen a características adaptativas y productivas importantes. Sin embargo, los mecanismos genéticos que controlan la organización de tipos celulares en el tiempo y el espacio para formar órganos han sido poco estudiados en plantas. Para identificar los cambios en la expresión genética que controlan la división y diferenciación celular durante este proceso, utilizamos la secuenciación de célula única. Esta técnica permite generar el perfil transcripcional de miles de células de forma rápida y con alta resolución. Así, descubrimos nuevos patrones de expresión tejido-específicos, y de movimiento a nivel de proteína, de factores de transcripción importantes. Identificamos un circuito genético que controla la emergencia de del patrón radial característico de raíces y presente también en la vasculatura de las hojas, esencial para el transporte y nutrientes y la eficiencia fotosintética.
Actualizado 2022-05-23 18:45:50
Biomolecular condensates in cellular stress responses and disease.
Simon Alberti. Professor of Cellular Biochemistry. Technische Universität Dresden. Center for Molecular and Cellular Bioengineering (CMCB). Biotechnology Center (BIOTEC)
Sede: Auditorio "Dr. Francisco G. Bolívar Zapata" del IBt/UNAM
01-Abril-2024 al 01-Abril-2024
05:00 PM
Dr. Rafael Martinez Gallegos
05:00 PM
Dr. Rafael Martinez Gallegos
Homologous recombination cloning: Tips, tricks and advantages
Using the endogenous homologous recombination of living organisms for cloning (HR-cloning) was first described in yeast and eventually in bacteria. Although not so widespread, this method allows the straightforward engineering of fusion proteins with the ability of exchanging elements from 1 nt to several kb within a plasmid. Therefore it can be used to manipulate codons or transcription factor target sequences as well as to study regulatory regions like full promoters or UTRs. Likewise, reporter markers can be exchanged having either N- or C-terminal variants. It also offers the possibility of engineering customized plasmids providing a different strategy to overcome difficulties in the cloning and editing of challenging DNA fragments. The manipulation steps are minimized and any recA1 bacteria strain is suitable for it. This method has been tested with common and customized plasmids with a range up to 15 kb. Its simplicity allows the implementation in any molecular biology laboratory without the requirement of any commercial Kit. I will discuss examples of HR-cloning on a wide variety of organisms, from plants to Drosophila.